More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3348 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3348  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 232 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  78.17 
 
 		 232 aa  367  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  78.17 
 
 		 232 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  78.17 
 
 		 232 aa  367  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  78.17 
 
 		 232 aa  367  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  78.17 
 
 		 232 aa  367  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  78.17 
 
 		 232 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  78.17 
 
 		 232 aa  367  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  78.17 
 
 		 232 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  78.6 
 
 		 232 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  79.04 
 
 		 232 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  78.17 
 
 		 232 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  76.42 
 
 		 232 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  76.52 
 
 		 231 aa  362  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  76.42 
 
 		 232 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  76.42 
 
 		 232 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  76.42 
 
 		 232 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  75.55 
 
 		 232 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  75.55 
 
 		 232 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  76.42 
 
 		 231 aa  359  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  76.42 
 
 		 231 aa  359  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  76.42 
 
 		 232 aa  358  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  74.67 
 
 		 231 aa  351  7e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0756  50S ribosomal protein L1  76.42 
 
 		 230 aa  345  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0043  50S ribosomal protein L1  74.14 
 
 		 233 aa  343  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236116  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3337  50S ribosomal protein L1  77.39 
 
 		 231 aa  341  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0269  50S ribosomal protein L1  76.86 
 
 		 230 aa  340  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  hitchhiker  0.00154879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0309  50S ribosomal protein L1P  78.17 
 
 		 231 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440135  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0039  50S ribosomal protein L1  72.84 
 
 		 233 aa  337  7e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00138059  hitchhiker  0.00000000000807787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3192  50S ribosomal protein L1  77.39 
 
 		 231 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.406576  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  70.43 
 
 		 237 aa  329  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3595  50S ribosomal protein L1  72.05 
 
 		 231 aa  321  8e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.412655  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3454  50S ribosomal protein L1P  71.55 
 
 		 235 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298186  normal  0.29676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0585  50S ribosomal protein L1  74.67 
 
 		 232 aa  318  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4534  50S ribosomal protein L1  73.04 
 
 		 231 aa  317  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  65.07 
 
 		 282 aa  315  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2334  ribosomal protein L1  67.69 
 
 		 231 aa  315  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000592022  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  62.5 
 
 		 232 aa  314  7e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  66.09 
 
 		 233 aa  314  9e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3900  50S ribosomal protein L1  72.93 
 
 		 231 aa  314  9e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3249  50S ribosomal protein L1  72.93 
 
 		 231 aa  314  9e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0487  50S ribosomal protein L1  67.69 
 
 		 230 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0570658  hitchhiker  0.00000155612 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0316  50S ribosomal protein L1  67.69 
 
 		 230 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246243  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  62.05 
 
 		 232 aa  313  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  66.96 
 
 		 231 aa  312  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4772  50S ribosomal protein L1  65.52 
 
 		 232 aa  312  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0687152  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  63.36 
 
 		 233 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0507  50S ribosomal protein L1  72.17 
 
 		 231 aa  311  6.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0148  ribosomal protein L1  64.94 
 
 		 233 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000518131  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  63.48 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  63.48 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3643  50S ribosomal protein L1  70.74 
 
 		 231 aa  310  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0709  50S ribosomal protein L1  66.67 
 
 		 232 aa  310  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4445  50S ribosomal protein L1  69.87 
 
 		 231 aa  309  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.369013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2334  50S ribosomal protein L1  67.39 
 
 		 231 aa  308  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.505693  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  65.94 
 
 		 231 aa  308  4e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0170  50S ribosomal protein L1  62.88 
 
 		 229 aa  306  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000255215  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3734  ribosomal protein L1  65.95 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0448  50S ribosomal protein L1P  68.7 
 
 		 231 aa  300  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  62.61 
 
 		 231 aa  298  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2869  50S ribosomal protein L1  61.14 
 
 		 234 aa  297  7e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000234009  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4556  50S ribosomal protein L1  64.78 
 
 		 234 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103924  decreased coverage  0.00000000000032652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4482  50S ribosomal protein L1  64.78 
 
 		 234 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  decreased coverage  0.0000000000000063048 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4360  50S ribosomal protein L1  64.78 
 
 		 234 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0197515  normal  0.388445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4392  50S ribosomal protein L1  64.78 
 
 		 234 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4479  50S ribosomal protein L1  64.78 
 
 		 234 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0614276  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0313  ribosomal protein L1  66.38 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000426699  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0274  50S ribosomal protein L1  65.94 
 
 		 234 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655427  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2261  ribosomal protein L1  69.57 
 
 		 231 aa  295  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0336  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 234 aa  295  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00681469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2807  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 234 aa  295  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532362  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  59.83 
 
 		 232 aa  295  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3863  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 234 aa  295  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  59.91 
 
 		 229 aa  294  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3888  ribosomal protein L1  65.22 
 
 		 234 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  61.06 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4327  50S ribosomal protein L1  65.95 
 
 		 233 aa  291  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000769687  hitchhiker  0.00000000219942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4700  50S ribosomal protein L1  66.38 
 
 		 233 aa  291  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000139189  hitchhiker  0.00000553638 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  64.44 
 
 		 231 aa  291  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0138  50S ribosomal protein L1  65.09 
 
 		 233 aa  291  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000376196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03860  50S ribosomal protein L1  64.78 
 
 		 234 aa  291  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000865195  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4524  50S ribosomal protein L1  64.78 
 
 		 234 aa  291  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100001  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5449  50S ribosomal protein L1  64.78 
 
 		 234 aa  291  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000118396  hitchhiker  0.00123384 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4472  50S ribosomal protein L1  64.78 
 
 		 234 aa  291  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362466  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4432  50S ribosomal protein L1  64.78 
 
 		 234 aa  291  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000639921  hitchhiker  0.0000029085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4041  50S ribosomal protein L1  64.78 
 
 		 234 aa  291  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000597884  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03813  hypothetical protein  64.78 
 
 		 234 aa  291  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000121828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4217  50S ribosomal protein L1  64.78 
 
 		 234 aa  291  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.26604e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3449  ribosomal protein L1  64.63 
 
 		 234 aa  291  6e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000354008  hitchhiker  0.00724733 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  60.34 
 
 		 232 aa  291  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  59.47 
 
 		 229 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  59.47 
 
 		 229 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0189  50S ribosomal protein L1  64.66 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324353  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4011  ribosomal protein L1  64.35 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3769  50S ribosomal protein L1  65.09 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000012914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0189  50S ribosomal protein L1  64.66 
 
 		 233 aa  289  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000305059  hitchhiker  0.00355335 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0184  50S ribosomal protein L1  64.66 
 
 		 233 aa  289  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000067503  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0194  50S ribosomal protein L1  65.07 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000443465  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0221  50S ribosomal protein L1  65.09 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2727  50S ribosomal protein L1  64.35 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000405483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>