More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2993 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 235 aa  471  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  84.26 
 
 		 235 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  82.55 
 
 		 235 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0442  50S ribosomal protein L1  81.28 
 
 		 235 aa  371  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2075  ribosomal protein L1  65.81 
 
 		 234 aa  322  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  61.04 
 
 		 234 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  59.57 
 
 		 234 aa  287  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  59.29 
 
 		 231 aa  287  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 234 aa  287  9e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  58.8 
 
 		 234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  58.52 
 
 		 233 aa  280  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  59.39 
 
 		 233 aa  280  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  58.52 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  60 
 
 		 232 aa  277  9e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  56.41 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  57.71 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  56.65 
 
 		 231 aa  276  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  58.08 
 
 		 233 aa  275  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  62.39 
 
 		 232 aa  275  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  59.19 
 
 		 235 aa  273  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  59.28 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 230 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 234 aa  271  7e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  58.08 
 
 		 233 aa  271  9e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  57.02 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  58.57 
 
 		 234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 232 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  58.57 
 
 		 234 aa  267  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  57.46 
 
 		 235 aa  267  8.999999999999999e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  58.57 
 
 		 234 aa  267  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  56.77 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 230 aa  265  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 229 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  57.64 
 
 		 232 aa  264  7e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  56.28 
 
 		 234 aa  264  8e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 229 aa  264  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  56.33 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  57.69 
 
 		 235 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  56.82 
 
 		 233 aa  261  6.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  53.91 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  58.52 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  55.11 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  58.12 
 
 		 235 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  58.12 
 
 		 235 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  58.12 
 
 		 235 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 232 aa  258  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 230 aa  258  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 230 aa  258  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  56.25 
 
 		 232 aa  258  8e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  55.6 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  52.68 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  56.14 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  54.08 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3361  50S ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 232 aa  254  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235181  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  59.71 
 
 		 233 aa  254  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 231 aa  254  9e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  55.66 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  56.84 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  53.42 
 
 		 236 aa  252  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 		 230 aa  251  5.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  52.16 
 
 		 238 aa  251  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  56.47 
 
 		 239 aa  251  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  55.12 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 229 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  53.62 
 
 		 282 aa  249  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3843  50S ribosomal protein L1  56.77 
 
 		 232 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528602  normal  0.697118 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  57.48 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  52.4 
 
 		 232 aa  248  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 232 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 232 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  51.93 
 
 		 235 aa  248  6e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 232 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  54.09 
 
 		 229 aa  248  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 232 aa  248  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1347  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  52.79 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 232 aa  248  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  52 
 
 		 232 aa  246  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  53.12 
 
 		 226 aa  247  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  51.72 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  55.84 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 229 aa  246  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>