More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23970 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  73.19 
 
 		 236 aa  356  1.9999999999999998e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  73.62 
 
 		 238 aa  354  5.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  72.05 
 
 		 236 aa  349  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  71.98 
 
 		 238 aa  347  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  72.77 
 
 		 259 aa  346  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  70.61 
 
 		 235 aa  345  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  69.79 
 
 		 238 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  70.34 
 
 		 237 aa  341  5.999999999999999e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  71.61 
 
 		 238 aa  335  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  64.68 
 
 		 238 aa  334  5.999999999999999e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  71.98 
 
 		 238 aa  333  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  63.83 
 
 		 238 aa  331  6e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  70.51 
 
 		 235 aa  329  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  72.05 
 
 		 238 aa  327  8e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  72.05 
 
 		 237 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  70.21 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  65.8 
 
 		 236 aa  326  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  69.06 
 
 		 225 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  70.09 
 
 		 235 aa  324  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  69.49 
 
 		 239 aa  325  6e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 235 aa  324  7e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  72.2 
 
 		 230 aa  322  5e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  69.23 
 
 		 237 aa  318  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 239 aa  317  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  68.51 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  68.51 
 
 		 237 aa  312  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6060  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 237 aa  312  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  67.26 
 
 		 231 aa  308  2.9999999999999997e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  65.95 
 
 		 259 aa  308  4e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  66.24 
 
 		 235 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  66.24 
 
 		 235 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  66.24 
 
 		 235 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5115  50S ribosomal protein L1  68.51 
 
 		 239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10654  50S ribosomal protein L1  68.1 
 
 		 235 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0559095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1113  ribosomal protein L1  68.18 
 
 		 238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17280  50S ribosomal protein L1  71.29 
 
 		 235 aa  297  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  63.39 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  57.26 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  57.87 
 
 		 235 aa  282  4.0000000000000003e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  56.25 
 
 		 230 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 231 aa  269  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  57.78 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 230 aa  265  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 230 aa  265  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  50.41 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  53.65 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  56.62 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  53.3 
 
 		 231 aa  259  4e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  55.7 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  59.47 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  56.83 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 231 aa  251  7e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  52.84 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  52.84 
 
 		 232 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  51.75 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  53.6 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  54.26 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  53.12 
 
 		 227 aa  250  2e-65  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2128  ribosomal protein L1  57.45 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  normal  0.786973 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  52.91 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  57.48 
 
 		 235 aa  248  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  52.47 
 
 		 234 aa  248  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  52.65 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  53.6 
 
 		 226 aa  246  3e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 234 aa  244  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 234 aa  244  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 242 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  57.69 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  54.79 
 
 		 229 aa  243  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 232 aa  242  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0285  50S ribosomal protein L1  55.71 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105773  hitchhiker  0.00394818 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0846  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 232 aa  242  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.408948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 233 aa  241  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 230 aa  241  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 232 aa  241  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 237 aa  241  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 235 aa  241  6e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  50.43 
 
 		 233 aa  241  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  57.59 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  53.02 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  50.43 
 
 		 237 aa  239  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  48 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>