More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0179 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 231 aa  464  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  93.04 
 
 		 230 aa  437  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  93.04 
 
 		 230 aa  437  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  74.24 
 
 		 230 aa  330  8e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  74.24 
 
 		 230 aa  329  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  74.24 
 
 		 230 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  74.24 
 
 		 230 aa  329  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  74.24 
 
 		 230 aa  329  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  74.24 
 
 		 230 aa  329  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  74.24 
 
 		 230 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  74.24 
 
 		 230 aa  329  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  73.25 
 
 		 233 aa  328  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  73.36 
 
 		 230 aa  325  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  72.93 
 
 		 230 aa  324  6e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  72.93 
 
 		 230 aa  323  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  71.93 
 
 		 233 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  68.56 
 
 		 229 aa  320  9.999999999999999e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  65.78 
 
 		 233 aa  318  5e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  65.78 
 
 		 230 aa  314  8e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  64.35 
 
 		 232 aa  308  5e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  62.67 
 
 		 231 aa  306  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  62.45 
 
 		 231 aa  306  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  65.92 
 
 		 230 aa  305  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  68.44 
 
 		 230 aa  304  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  59.65 
 
 		 235 aa  300  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  63.27 
 
 		 233 aa  300  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 229 aa  299  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  63.44 
 
 		 233 aa  296  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  65.5 
 
 		 229 aa  295  3e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  60.43 
 
 		 253 aa  295  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  67.41 
 
 		 231 aa  295  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  63.76 
 
 		 232 aa  293  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  60.79 
 
 		 234 aa  290  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  61.57 
 
 		 229 aa  289  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  59.91 
 
 		 235 aa  288  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  61.26 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  63.16 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  64.13 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  59.91 
 
 		 234 aa  287  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  60.35 
 
 		 233 aa  287  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  58.3 
 
 		 233 aa  285  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  56.96 
 
 		 235 aa  285  5e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 235 aa  284  8e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  58.59 
 
 		 236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  57.64 
 
 		 230 aa  279  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  60 
 
 		 235 aa  280  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  63.84 
 
 		 230 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  59.38 
 
 		 233 aa  278  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  59.38 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 236 aa  275  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  64.29 
 
 		 229 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  64.29 
 
 		 229 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  57.52 
 
 		 226 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  56.83 
 
 		 238 aa  272  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  54.78 
 
 		 234 aa  272  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 242 aa  271  7e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 238 aa  271  8.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  59.07 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  56 
 
 		 232 aa  270  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  59.07 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  58.6 
 
 		 234 aa  269  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 232 aa  270  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  58.26 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 237 aa  268  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 227 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  54.63 
 
 		 238 aa  268  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 234 aa  267  8e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  56.25 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 231 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 232 aa  265  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 230 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  57.67 
 
 		 234 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  53.48 
 
 		 234 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 232 aa  265  7e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  52 
 
 		 235 aa  265  7e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 229 aa  264  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00040  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 232 aa  264  8e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  54.71 
 
 		 225 aa  263  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0423  50S ribosomal protein L1  57.02 
 
 		 229 aa  263  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000383524  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 231 aa  264  1e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 232 aa  264  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1418  50S ribosomal protein L1P  53.74 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214693  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  54.09 
 
 		 229 aa  262  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  54.63 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 238 aa  261  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 229 aa  261  4.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 236 aa  261  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 229 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 233 aa  261  8.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  53.91 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>