More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl608 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 227 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  77.88 
 
 		 226 aa  367  1e-101  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 233 aa  275  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 231 aa  271  9e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 231 aa  268  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  57.59 
 
 		 236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 229 aa  266  2.9999999999999995e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 236 aa  263  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  58.33 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  53.98 
 
 		 235 aa  261  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  56.82 
 
 		 230 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  53.07 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  54.02 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 236 aa  258  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  54.87 
 
 		 238 aa  258  7e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  55.2 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  55.31 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 231 aa  256  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  56.7 
 
 		 259 aa  255  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 235 aa  255  5e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 233 aa  254  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 230 aa  254  7e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 237 aa  254  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  52.68 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  54.39 
 
 		 230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  52 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 225 aa  251  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 229 aa  251  9.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  53.12 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  57.78 
 
 		 231 aa  249  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  53.07 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 234 aa  248  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  50.23 
 
 		 230 aa  248  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 234 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 234 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  51.75 
 
 		 242 aa  248  7e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  52.86 
 
 		 233 aa  247  9e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  53.81 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  56.6 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  56.44 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  55.8 
 
 		 238 aa  245  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  52.23 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  52.42 
 
 		 231 aa  244  6.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  52.11 
 
 		 235 aa  244  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  54.87 
 
 		 237 aa  244  8e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  51.32 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf143  50S ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 230 aa  243  3e-63  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 236 aa  242  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  51.34 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  49.13 
 
 		 242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  52.19 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 234 aa  241  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 230 aa  241  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 230 aa  241  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 234 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 235 aa  241  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  52 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  52.23 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  54.25 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  54.25 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 237 aa  239  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  52.4 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  52.65 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  51.17 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  51.33 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  49.55 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  49.11 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>