More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4019 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  62.61 
 
 		 233 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  63.68 
 
 		 234 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  61.74 
 
 		 233 aa  289  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  62.39 
 
 		 234 aa  289  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  60.62 
 
 		 230 aa  288  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  60.62 
 
 		 230 aa  288  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  60.18 
 
 		 233 aa  288  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  61.95 
 
 		 233 aa  285  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 231 aa  284  8e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  61.06 
 
 		 234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  58.33 
 
 		 231 aa  282  4.0000000000000003e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  58.04 
 
 		 232 aa  279  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  58.52 
 
 		 233 aa  278  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 234 aa  278  7e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 230 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  60.09 
 
 		 233 aa  275  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  61.29 
 
 		 233 aa  274  8e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  59.19 
 
 		 235 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  64.16 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 230 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  59.36 
 
 		 234 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 235 aa  271  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  58.9 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  58.9 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 231 aa  269  2.9999999999999997e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  63.27 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  57.53 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  56.96 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  61.57 
 
 		 232 aa  265  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2075  ribosomal protein L1  59.29 
 
 		 234 aa  265  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  56.39 
 
 		 242 aa  264  8e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  56.65 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  56.33 
 
 		 232 aa  261  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  57.85 
 
 		 230 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  55.8 
 
 		 236 aa  261  8e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  59.21 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  56.5 
 
 		 233 aa  260  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  59.56 
 
 		 229 aa  258  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  59.56 
 
 		 229 aa  258  7e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 230 aa  256  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 230 aa  256  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 230 aa  256  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 230 aa  256  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  58.77 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  56.76 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 230 aa  256  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 230 aa  256  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 230 aa  256  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 230 aa  256  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  56.33 
 
 		 231 aa  255  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 229 aa  255  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 236 aa  255  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0442  50S ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 235 aa  254  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  56.76 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  56.83 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 232 aa  251  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 242 aa  251  6e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  55.61 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 230 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  54.55 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  51.29 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  52.47 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  51.8 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  52.91 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  55.86 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  55.41 
 
 		 238 aa  248  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 231 aa  248  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 232 aa  248  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  53.81 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  54.05 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  53.28 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  52.91 
 
 		 229 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 238 aa  244  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  54.95 
 
 		 225 aa  244  6.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  52.11 
 
 		 227 aa  244  8e-64  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  52.68 
 
 		 231 aa  244  8e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  51.8 
 
 		 226 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  52.65 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1179  50S ribosomal protein L1  56.58 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00131396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1965  50S ribosomal protein L1  54.55 
 
 		 229 aa  242  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0834753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  53.81 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  54.09 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  53.64 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  54.09 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>