More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1179 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1179  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00131396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  84.51 
 
 		 229 aa  392  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0641  50S ribosomal protein L1  65.67 
 
 		 233 aa  297  8e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  55.61 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 233 aa  264  8.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 231 aa  258  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  56.58 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  53.57 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  53.07 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 230 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  52 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  52.4 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  52.4 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  51.93 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  52.91 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 235 aa  244  6e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  49.34 
 
 		 242 aa  244  6e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  51.98 
 
 		 233 aa  244  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 238 aa  244  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  53.42 
 
 		 236 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  52.21 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  51.36 
 
 		 230 aa  241  5e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 235 aa  241  9e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  58.08 
 
 		 233 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  51.36 
 
 		 226 aa  240  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  54.87 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  48.68 
 
 		 235 aa  238  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  50.85 
 
 		 242 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2075  ribosomal protein L1  51.72 
 
 		 234 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  49.56 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  51.3 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  50.66 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  48.03 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2553  50S ribosomal protein L1  51.57 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000296242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3361  50S ribosomal protein L1  51.07 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235181  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1039  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 238 aa  235  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0123648  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0633  50S ribosomal protein L1  51.12 
 
 		 237 aa  235  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.846201 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  51.75 
 
 		 234 aa  235  4e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  51.05 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  49.34 
 
 		 232 aa  234  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  48 
 
 		 235 aa  234  7e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 231 aa  234  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 229 aa  234  8e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 233 aa  234  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  47.64 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  50.21 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  50.21 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  50.21 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0423  50S ribosomal protein L1  52.84 
 
 		 229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000383524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  48.48 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  51.75 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  53.12 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  51.97 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  48.9 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  48.48 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1570  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  50.87 
 
 		 232 aa  232  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 234 aa  232  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02791  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.475982  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  48.9 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  48.03 
 
 		 232 aa  231  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  48.03 
 
 		 232 aa  231  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  48.9 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  50.64 
 
 		 232 aa  232  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 232 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 232 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  52.04 
 
 		 229 aa  231  5e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  50.64 
 
 		 232 aa  231  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  48.9 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  49.34 
 
 		 232 aa  231  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  51.4 
 
 		 234 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  51.4 
 
 		 234 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  49.32 
 
 		 229 aa  231  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  51.4 
 
 		 234 aa  231  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0391  50S ribosomal protein L1  46.35 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  49.35 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  48.5 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  49.13 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>