More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0522 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  100 
 
 		 235 aa  472  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2952  ribosomal protein L1  79.15 
 
 		 235 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00907027  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  56.96 
 
 		 233 aa  287  9e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 231 aa  282  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 230 aa  275  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  59.01 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 231 aa  274  9e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  56.9 
 
 		 232 aa  271  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  50.89 
 
 		 235 aa  271  9e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  58.26 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  58.26 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  52 
 
 		 231 aa  265  7e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 230 aa  264  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  51.07 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  51.32 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 230 aa  262  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  51.34 
 
 		 238 aa  261  8e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  57.85 
 
 		 229 aa  260  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  57.85 
 
 		 229 aa  260  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  51.56 
 
 		 238 aa  258  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 230 aa  258  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 242 aa  257  9e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  53.64 
 
 		 229 aa  257  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 230 aa  257  9e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  52.86 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  49.55 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  52.65 
 
 		 232 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  51.79 
 
 		 236 aa  255  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  52.21 
 
 		 235 aa  255  5e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 229 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  51.12 
 
 		 225 aa  255  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  56.36 
 
 		 236 aa  254  7e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  49.11 
 
 		 241 aa  254  8e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  50.21 
 
 		 235 aa  254  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  52.42 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 231 aa  251  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 236 aa  251  5.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 234 aa  251  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  51.29 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  51.36 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  50.91 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 235 aa  248  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  48.67 
 
 		 259 aa  248  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 235 aa  248  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 229 aa  248  7e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 238 aa  247  9e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  51.79 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  50 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  51.5 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0255  50S ribosomal protein L1  52.42 
 
 		 241 aa  245  4e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000222102  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 235 aa  245  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 236 aa  244  6e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  50.64 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  50.64 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  50.64 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  49.34 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  48.68 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  52.21 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  52.21 
 
 		 237 aa  242  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  52.21 
 
 		 239 aa  241  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  51.34 
 
 		 237 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  50.91 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  48 
 
 		 239 aa  239  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  49.12 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  46.19 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  48.67 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  49.56 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0230  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 229 aa  238  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000338743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  51.34 
 
 		 237 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  51.79 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>