More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0123 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  70.13 
 
 		 237 aa  345  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3327  50S ribosomal protein L1  70.04 
 
 		 240 aa  337  8e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24535  normal  0.407372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  64.44 
 
 		 242 aa  325  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4319  50S ribosomal protein L1  68.94 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.686674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  55.98 
 
 		 235 aa  265  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  59.64 
 
 		 236 aa  261  8.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0883  50S ribosomal protein L1  53.68 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.184517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  56.58 
 
 		 237 aa  258  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  56.77 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  56.71 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 239 aa  254  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  57.4 
 
 		 238 aa  254  7e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 235 aa  254  7e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  52.4 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  53.68 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  54.26 
 
 		 231 aa  249  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  53.25 
 
 		 238 aa  248  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 238 aa  248  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  56.03 
 
 		 237 aa  248  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  55.07 
 
 		 238 aa  248  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  58.08 
 
 		 238 aa  248  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 236 aa  248  7e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  54.11 
 
 		 235 aa  248  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 231 aa  245  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  52.65 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  52.19 
 
 		 241 aa  245  4e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 		 229 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 		 229 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 233 aa  244  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  53.3 
 
 		 225 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  53.95 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  52.65 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 234 aa  241  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  53.78 
 
 		 239 aa  241  6e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 238 aa  241  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  51.07 
 
 		 235 aa  241  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 232 aa  241  7.999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 230 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  51.97 
 
 		 234 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  50.63 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6060  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  50.21 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_002936  DET0992  50S ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 237 aa  239  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000282908  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 230 aa  240  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 230 aa  238  4e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_864  ribosomal protein L1  51.08 
 
 		 237 aa  238  4e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00524668  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  53.85 
 
 		 235 aa  238  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 259 aa  238  8e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  49.14 
 
 		 235 aa  238  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  57.4 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  53.42 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  54.98 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  48.71 
 
 		 235 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  52.65 
 
 		 231 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  51.34 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  51.3 
 
 		 233 aa  235  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  49.34 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  53.12 
 
 		 230 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0641  50S ribosomal protein L1  56.17 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  51.74 
 
 		 232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  53.68 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  53.68 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  53.68 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  56.28 
 
 		 238 aa  234  7e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  48.28 
 
 		 235 aa  234  7e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  50.21 
 
 		 233 aa  234  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  47.84 
 
 		 235 aa  234  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  52.19 
 
 		 230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  49.56 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 232 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  50.89 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  51.79 
 
 		 229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  51.28 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  52.4 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  49.35 
 
 		 238 aa  232  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  49.35 
 
 		 238 aa  231  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 237 aa  231  6e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  54.19 
 
 		 230 aa  231  6e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  54.5 
 
 		 233 aa  231  7.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  52.09 
 
 		 234 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  52.09 
 
 		 234 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  52.09 
 
 		 234 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0391  50S ribosomal protein L1  51.57 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  51.34 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  51.32 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>