More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4679 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  63.04 
 
 		 232 aa  295  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  63.72 
 
 		 235 aa  285  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 231 aa  278  5e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  59.47 
 
 		 233 aa  275  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  59.01 
 
 		 230 aa  275  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  59.57 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  60.18 
 
 		 233 aa  274  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  59.91 
 
 		 234 aa  272  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 233 aa  271  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  59.29 
 
 		 234 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  59.48 
 
 		 233 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 234 aa  271  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  57.63 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  56.65 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 231 aa  268  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  61.46 
 
 		 229 aa  267  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 232 aa  266  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 235 aa  261  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  56.71 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  54.55 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  53.62 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  58.33 
 
 		 234 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  59.43 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  59.43 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  53.85 
 
 		 235 aa  256  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  54.88 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  58.96 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  53.68 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  53.68 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0255  50S ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000222102  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  57.94 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  53.48 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  57.47 
 
 		 229 aa  252  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  57.26 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  54.39 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  56.39 
 
 		 230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  51.49 
 
 		 234 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 230 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 253 aa  249  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  53.48 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  58.04 
 
 		 231 aa  249  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  57.01 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 232 aa  249  3e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  50 
 
 		 242 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  59.13 
 
 		 230 aa  249  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  50.43 
 
 		 232 aa  247  9e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  53.48 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  53.91 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  55.84 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2682  50S ribosomal protein L1  58.82 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286692  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  59.13 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 226 aa  246  3e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  56.41 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  53 
 
 		 241 aa  245  4e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  53.22 
 
 		 232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1965  50S ribosomal protein L1  58.37 
 
 		 229 aa  244  6e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0834753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0285  50S ribosomal protein L1  60.49 
 
 		 229 aa  244  6.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105773  hitchhiker  0.00394818 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 236 aa  244  8e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 235 aa  244  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0391  50S ribosomal protein L1  52.65 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 230 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  53.45 
 
 		 231 aa  243  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0230  50S ribosomal protein L1  57.92 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000338743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  59.13 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  56.84 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  53.42 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00040  50S ribosomal protein L1  54.63 
 
 		 232 aa  243  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0846  50S ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 232 aa  242  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.408948 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  55.77 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  52.38 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  59.09 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  59.09 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  53.12 
 
 		 236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  54.31 
 
 		 231 aa  241  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>