More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2682 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2682  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286692  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  86.03 
 
 		 229 aa  407  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0230  50S ribosomal protein L1  92.14 
 
 		 229 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000338743  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  87.34 
 
 		 229 aa  392  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1965  50S ribosomal protein L1  88.21 
 
 		 229 aa  388  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0834753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  78.6 
 
 		 229 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0285  50S ribosomal protein L1  79.04 
 
 		 229 aa  349  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105773  hitchhiker  0.00394818 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 232 aa  278  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 231 aa  277  8e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 232 aa  274  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  60.37 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  59.36 
 
 		 232 aa  270  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  61.75 
 
 		 232 aa  269  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  57.99 
 
 		 235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 233 aa  267  8.999999999999999e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 233 aa  267  8.999999999999999e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 233 aa  267  8.999999999999999e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00040  50S ribosomal protein L1  57.59 
 
 		 232 aa  267  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  58.82 
 
 		 234 aa  265  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  56.82 
 
 		 231 aa  264  8e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  58.82 
 
 		 234 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0391  50S ribosomal protein L1  58.45 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  56.62 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  59.36 
 
 		 238 aa  261  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  58.82 
 
 		 235 aa  261  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  56.5 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  56.25 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  57.99 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 234 aa  258  4e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0846  50S ribosomal protein L1  56.76 
 
 		 232 aa  258  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.408948 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  55.45 
 
 		 233 aa  258  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0423  50S ribosomal protein L1  57.99 
 
 		 229 aa  257  9e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000383524  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  54.71 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  57.53 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  55.66 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  52.68 
 
 		 241 aa  255  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 233 aa  255  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  57.73 
 
 		 233 aa  255  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 232 aa  254  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  55.91 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  52.38 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  57.47 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  53.36 
 
 		 239 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  52 
 
 		 231 aa  251  5.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1666  50S ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  56.11 
 
 		 233 aa  251  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  55.66 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  55.16 
 
 		 242 aa  251  8.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  56.82 
 
 		 230 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  51.6 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  54.79 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  56.22 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  53.39 
 
 		 225 aa  249  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  56.22 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1707  50S ribosomal protein L1  54.95 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  52.47 
 
 		 233 aa  248  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  54.55 
 
 		 235 aa  248  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  54.34 
 
 		 236 aa  248  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  56.36 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  52.02 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  55.3 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  55 
 
 		 235 aa  245  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  53.6 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 230 aa  244  6e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  53.18 
 
 		 234 aa  244  8e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  56.36 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  53.42 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  49.09 
 
 		 235 aa  242  3e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2075  ribosomal protein L1  54.75 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  53 
 
 		 234 aa  241  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  52.73 
 
 		 234 aa  242  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0178  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 233 aa  241  7e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0966549  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  54.75 
 
 		 230 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  57.01 
 
 		 230 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  56.82 
 
 		 238 aa  241  7.999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  52.23 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  51.34 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  55.2 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  55.2 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  55.2 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  50.45 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  54.3 
 
 		 229 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  52.51 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  56.62 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>