More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21010 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  100 
 
 		 230 aa  467  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  75.78 
 
 		 238 aa  352  4e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  72.32 
 
 		 236 aa  350  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  74.77 
 
 		 236 aa  348  4e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  72.89 
 
 		 225 aa  347  7e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  70.98 
 
 		 235 aa  345  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  74.55 
 
 		 259 aa  344  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  73.87 
 
 		 238 aa  343  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  72.2 
 
 		 239 aa  342  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  72.25 
 
 		 238 aa  341  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  73.21 
 
 		 238 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  72.32 
 
 		 237 aa  336  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  73.09 
 
 		 238 aa  328  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  72.77 
 
 		 237 aa  324  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  72.2 
 
 		 235 aa  323  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 236 aa  321  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  65.18 
 
 		 238 aa  321  5e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  64.29 
 
 		 238 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  69.03 
 
 		 231 aa  319  1.9999999999999998e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  71.75 
 
 		 235 aa  318  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  66.82 
 
 		 235 aa  316  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  70.98 
 
 		 237 aa  314  9e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  69.2 
 
 		 239 aa  309  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  68.16 
 
 		 237 aa  308  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  65.62 
 
 		 230 aa  304  7e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  67.71 
 
 		 235 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  67.71 
 
 		 235 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  67.71 
 
 		 235 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  66.07 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  66.37 
 
 		 237 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  64.13 
 
 		 239 aa  298  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  65.18 
 
 		 259 aa  298  5e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6060  50S ribosomal protein L1  65.62 
 
 		 237 aa  297  9e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10654  50S ribosomal protein L1  67.71 
 
 		 235 aa  297  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0559095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5115  50S ribosomal protein L1  68.61 
 
 		 239 aa  295  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1113  ribosomal protein L1  68.25 
 
 		 238 aa  294  8e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  66.37 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17280  50S ribosomal protein L1  69.27 
 
 		 235 aa  285  4e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  62.83 
 
 		 229 aa  282  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  56.7 
 
 		 241 aa  276  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 235 aa  277  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  58.64 
 
 		 231 aa  276  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  60.62 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  63.23 
 
 		 229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 230 aa  265  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 230 aa  265  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 235 aa  265  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  56.7 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  57.78 
 
 		 226 aa  264  1e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  55.66 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  57.78 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  52.65 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  58.37 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  56.56 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  57.73 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  57.6 
 
 		 229 aa  261  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  54.26 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2128  ribosomal protein L1  59.19 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  normal  0.786973 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  52.47 
 
 		 233 aa  258  8e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  54.71 
 
 		 235 aa  255  3e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  55.16 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  52.21 
 
 		 253 aa  254  8e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 233 aa  254  9e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0846  50S ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.408948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  51.98 
 
 		 233 aa  252  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1965  50S ribosomal protein L1  56.36 
 
 		 229 aa  252  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0834753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0285  50S ribosomal protein L1  58.53 
 
 		 229 aa  252  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105773  hitchhiker  0.00394818 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  56.5 
 
 		 233 aa  251  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  57.6 
 
 		 229 aa  251  9.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  52.4 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  51.36 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1418  50S ribosomal protein L1P  53.1 
 
 		 230 aa  250  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 231 aa  249  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 235 aa  248  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  54.27 
 
 		 235 aa  248  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 235 aa  248  5e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  51.3 
 
 		 232 aa  248  6e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  52.42 
 
 		 236 aa  248  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 231 aa  248  7e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  55.45 
 
 		 232 aa  248  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  55.4 
 
 		 234 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  52.42 
 
 		 233 aa  247  9e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0391  50S ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>