More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0856 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  100 
 
 
230 aa  461  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  74.12 
 
 
230 aa  359  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  77.29 
 
 
231 aa  348  3e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  78.85 
 
 
229 aa  345  3e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  78.85 
 
 
229 aa  345  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  73.8 
 
 
230 aa  338  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  68.28 
 
 
231 aa  331  5e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  65.2 
 
 
233 aa  317  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  69.43 
 
 
230 aa  316  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  65.5 
 
 
231 aa  315  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  64.91 
 
 
232 aa  315  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  65.2 
 
 
233 aa  314  6e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  65.78 
 
 
235 aa  308  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  67.25 
 
 
232 aa  308  5e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  66.96 
 
 
236 aa  306  1.0000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  66.08 
 
 
230 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  62.11 
 
 
233 aa  302  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  72 
 
 
233 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  63.84 
 
 
231 aa  301  6.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  61.84 
 
 
242 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  62.95 
 
 
230 aa  298  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  62.95 
 
 
230 aa  298  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 
233 aa  297  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  70.67 
 
 
233 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  63.39 
 
 
233 aa  296  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  63.84 
 
 
234 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  61.47 
 
 
242 aa  294  8e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  62.9 
 
 
234 aa  291  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  62.11 
 
 
242 aa  291  6e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  62.5 
 
 
233 aa  291  7e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  62.5 
 
 
233 aa  290  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  62.05 
 
 
233 aa  288  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  58.33 
 
 
234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  68.3 
 
 
230 aa  288  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  68.3 
 
 
230 aa  288  6e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  68.3 
 
 
230 aa  288  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  68.3 
 
 
230 aa  288  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  68.3 
 
 
230 aa  288  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  68.3 
 
 
230 aa  288  6e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  68.3 
 
 
230 aa  288  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  67.41 
 
 
230 aa  287  9e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  67.41 
 
 
230 aa  287  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 
233 aa  286  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  67.86 
 
 
230 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  62.72 
 
 
229 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  58.08 
 
 
241 aa  286  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  61.78 
 
 
233 aa  286  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 
232 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  61.78 
 
 
233 aa  285  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  64.45 
 
 
234 aa  284  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  64.45 
 
 
234 aa  284  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  59.21 
 
 
230 aa  284  8e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  57.96 
 
 
234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  57.85 
 
 
235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  57.96 
 
 
235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  63.98 
 
 
234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  66.96 
 
 
230 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  63.03 
 
 
234 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  57.02 
 
 
235 aa  279  3e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  57.52 
 
 
236 aa  278  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  58.74 
 
 
230 aa  278  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  59.82 
 
 
234 aa  276  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  55.51 
 
 
242 aa  275  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 
235 aa  275  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  55.75 
 
 
235 aa  273  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 
237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  56.33 
 
 
235 aa  272  3e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  57.59 
 
 
229 aa  271  5.000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  58.37 
 
 
229 aa  271  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3327  50S ribosomal protein L1  55.51 
 
 
240 aa  268  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24535  normal  0.407372 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  59.28 
 
 
229 aa  266  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 
235 aa  266  2.9999999999999995e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  57.66 
 
 
232 aa  266  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  55.31 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 
236 aa  264  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 
226 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 
229 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 
229 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  53.1 
 
 
238 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  56.09 
 
 
230 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  59.91 
 
 
229 aa  262  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  53.1 
 
 
238 aa  261  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 
229 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 
232 aa  261  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 
230 aa  261  8.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 
231 aa  260  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1441  50S ribosomal protein L1  61.61 
 
 
232 aa  259  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0252476  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  58.49 
 
 
232 aa  259  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
231 aa  259  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 
236 aa  259  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  52.19 
 
 
235 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2952  ribosomal protein L1  59.73 
 
 
235 aa  259  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00907027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  58.48 
 
 
232 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  55.26 
 
 
233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
227 aa  258  7e-68  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 
233 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  51.75 
 
 
235 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  52.21 
 
 
236 aa  256  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  54.39 
 
 
235 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 
237 aa  255  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>