More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0099 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 233 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  97.42 
 
 		 233 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  85.22 
 
 		 230 aa  370  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  86.03 
 
 		 230 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  85.22 
 
 		 230 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  84.78 
 
 		 230 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  84.78 
 
 		 230 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  84.78 
 
 		 230 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  84.78 
 
 		 230 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  84.78 
 
 		 230 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  84.78 
 
 		 230 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  84.78 
 
 		 230 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  83.91 
 
 		 230 aa  363  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  73.25 
 
 		 231 aa  349  2e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  71.93 
 
 		 230 aa  344  5e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  71.93 
 
 		 230 aa  344  5e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  70.82 
 
 		 233 aa  339  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  69.33 
 
 		 231 aa  329  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 231 aa  319  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  65.33 
 
 		 235 aa  318  5e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  70.09 
 
 		 230 aa  317  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 232 aa  314  9e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  65.5 
 
 		 234 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  70.48 
 
 		 232 aa  310  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  64.91 
 
 		 229 aa  308  4e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  63.76 
 
 		 234 aa  307  9e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  65.49 
 
 		 233 aa  307  9e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  65.33 
 
 		 233 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  66.08 
 
 		 235 aa  304  8.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  70.74 
 
 		 231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  69.47 
 
 		 230 aa  302  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  63.72 
 
 		 230 aa  302  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  69.16 
 
 		 230 aa  301  7.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  63.44 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  61.04 
 
 		 233 aa  300  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  63.76 
 
 		 233 aa  299  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  63.04 
 
 		 233 aa  298  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  66.08 
 
 		 229 aa  298  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  62.01 
 
 		 233 aa  297  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  70.67 
 
 		 230 aa  296  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  67.69 
 
 		 230 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  61.5 
 
 		 253 aa  293  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  61.23 
 
 		 238 aa  291  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  61.78 
 
 		 233 aa  291  8e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  69.03 
 
 		 229 aa  290  9e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  69.03 
 
 		 229 aa  290  9e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  63.27 
 
 		 235 aa  290  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  64.63 
 
 		 229 aa  289  3e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  61.36 
 
 		 229 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  59.32 
 
 		 242 aa  288  6e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  59.91 
 
 		 236 aa  287  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  58.59 
 
 		 238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  59.57 
 
 		 233 aa  285  4e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  61.95 
 
 		 226 aa  285  5e-76  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 236 aa  285  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  60.87 
 
 		 230 aa  284  7e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 232 aa  284  7e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  59.57 
 
 		 233 aa  284  7e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  64.81 
 
 		 234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  63.32 
 
 		 229 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  64.81 
 
 		 234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  64.81 
 
 		 234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  59.39 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  58.26 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 225 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  59.09 
 
 		 229 aa  281  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  63.01 
 
 		 234 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  58.26 
 
 		 242 aa  279  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  64.47 
 
 		 236 aa  279  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  59.83 
 
 		 235 aa  280  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  60.35 
 
 		 235 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  56.22 
 
 		 242 aa  278  6e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 237 aa  277  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 227 aa  277  1e-73  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  57.26 
 
 		 235 aa  277  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  61.47 
 
 		 235 aa  276  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  63 
 
 		 239 aa  276  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  59.21 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  60.61 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 234 aa  276  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  58.67 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  58.44 
 
 		 235 aa  275  4e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1418  50S ribosomal protein L1P  57.27 
 
 		 230 aa  274  7e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214693  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  60 
 
 		 229 aa  274  8e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  62.11 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  56.44 
 
 		 239 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  64 
 
 		 238 aa  271  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  57.83 
 
 		 231 aa  271  7e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  59.11 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2952  ribosomal protein L1  62.45 
 
 		 235 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00907027  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  61.67 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 237 aa  268  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>