More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0358 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 236 aa  472  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  66.09 
 
 		 233 aa  328  6e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  66.52 
 
 		 233 aa  327  8e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  63.64 
 
 		 235 aa  319  1.9999999999999998e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  62.77 
 
 		 232 aa  315  5e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  61.06 
 
 		 231 aa  291  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  62.33 
 
 		 230 aa  291  6e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  60.62 
 
 		 233 aa  281  6.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  56.9 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  55.84 
 
 		 232 aa  275  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 231 aa  275  6e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 234 aa  272  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 235 aa  272  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  54.78 
 
 		 242 aa  271  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  54.11 
 
 		 241 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 233 aa  269  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 234 aa  269  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  57.58 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  56.25 
 
 		 235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  58.55 
 
 		 233 aa  268  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  53.85 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  58.12 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  58.8 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  58.04 
 
 		 231 aa  262  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  55.41 
 
 		 233 aa  261  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  55.8 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  55.66 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  52.99 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  53.85 
 
 		 235 aa  259  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  54.55 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  54.87 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  55.66 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 237 aa  258  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  54.39 
 
 		 238 aa  258  8e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 225 aa  257  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  54.39 
 
 		 236 aa  256  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  55.7 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 235 aa  255  4e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3327  50S ribosomal protein L1  53.14 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24535  normal  0.407372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  56.14 
 
 		 235 aa  255  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  52.16 
 
 		 231 aa  255  5e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  54.15 
 
 		 230 aa  254  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  58.87 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  58.87 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  58.87 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  58.87 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  58.87 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  57.89 
 
 		 238 aa  254  8e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  58.87 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  58.87 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 229 aa  254  8e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  58.87 
 
 		 230 aa  254  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  58.87 
 
 		 230 aa  254  9e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  56.76 
 
 		 230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  53.12 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  58.87 
 
 		 230 aa  252  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 234 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  52.63 
 
 		 239 aa  251  6e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 230 aa  251  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  57.52 
 
 		 235 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  58.26 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  53.48 
 
 		 232 aa  250  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  51.74 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  51.74 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  51.57 
 
 		 229 aa  248  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  54.11 
 
 		 232 aa  248  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  55.3 
 
 		 234 aa  247  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  55.3 
 
 		 234 aa  247  9e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  53.68 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  53.57 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  52.38 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4319  50S ribosomal protein L1  53.45 
 
 		 240 aa  246  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.686674  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  53.07 
 
 		 227 aa  246  3e-64  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  54.84 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  57.6 
 
 		 231 aa  245  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  51.98 
 
 		 226 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1418  50S ribosomal protein L1P  52.63 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214693  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  53.25 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  53.1 
 
 		 235 aa  244  8e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  48.72 
 
 		 236 aa  244  8e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  51.34 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  56.68 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 239 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  52.81 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  56.68 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 236 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 229 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 229 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  52.81 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  52.21 
 
 		 234 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  52.81 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>