More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0592 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 231 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  56 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 231 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 231 aa  265  7e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 232 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  54.55 
 
 		 232 aa  261  6.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  51.97 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  50.87 
 
 		 235 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  51.72 
 
 		 235 aa  256  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  52.84 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 230 aa  255  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 230 aa  255  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 233 aa  254  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  54.02 
 
 		 233 aa  254  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 233 aa  254  9e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  51.53 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  52 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  51.08 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  54.63 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  52.38 
 
 		 234 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  52.53 
 
 		 233 aa  250  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 231 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 234 aa  248  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 234 aa  248  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 231 aa  247  9e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 238 aa  247  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  50.43 
 
 		 235 aa  247  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2869  50S ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 234 aa  246  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000234009  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  51.12 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  56.33 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  53.24 
 
 		 234 aa  245  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  51.56 
 
 		 259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 233 aa  244  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 230 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 235 aa  243  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  50.66 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  47.66 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  50.65 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 235 aa  242  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 236 aa  242  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  49.14 
 
 		 232 aa  243  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  50 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  49.12 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  49.57 
 
 		 232 aa  241  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  54.15 
 
 		 230 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  51.54 
 
 		 233 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 229 aa  241  9e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 230 aa  241  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 230 aa  241  9e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 229 aa  241  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  49.57 
 
 		 238 aa  241  9e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  52 
 
 		 231 aa  241  9e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  51.08 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  49.35 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  48.03 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  51.08 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 231 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  49.14 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  49.35 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 230 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 230 aa  239  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4772  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0687152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  52.04 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  52.23 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  49.35 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  49.35 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  48.92 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>