More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2705 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  100 
 
 
235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  97.86 
 
 
235 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  76.92 
 
 
238 aa  367  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  77.68 
 
 
238 aa  360  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  76.6 
 
 
236 aa  359  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  77.78 
 
 
238 aa  357  9e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  74.35 
 
 
259 aa  356  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  73.5 
 
 
235 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  74.12 
 
 
235 aa  352  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  72.96 
 
 
238 aa  348  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  74.89 
 
 
238 aa  347  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  74.67 
 
 
237 aa  346  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  71.86 
 
 
236 aa  347  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  72.53 
 
 
239 aa  343  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17280  50S ribosomal protein L1  80.52 
 
 
235 aa  342  2e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  70.51 
 
 
239 aa  341  5e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  74.89 
 
 
237 aa  341  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  73.93 
 
 
237 aa  340  8e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  73.09 
 
 
225 aa  340  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  69.83 
 
 
238 aa  338  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  69.83 
 
 
238 aa  337  5.9999999999999996e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  72.77 
 
 
235 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  72.77 
 
 
235 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  72.77 
 
 
235 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  73.16 
 
 
237 aa  331  5e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  73.04 
 
 
238 aa  330  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5115  50S ribosomal protein L1  74.36 
 
 
239 aa  328  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10654  50S ribosomal protein L1  73.48 
 
 
235 aa  327  9e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0559095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  68.75 
 
 
236 aa  324  7e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1113  ribosomal protein L1  73.18 
 
 
238 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  71.98 
 
 
239 aa  319  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  72.2 
 
 
230 aa  318  5e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  72.17 
 
 
237 aa  315  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  69.1 
 
 
239 aa  311  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6060  50S ribosomal protein L1  68.53 
 
 
237 aa  309  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166987  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  66.52 
 
 
230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  67.83 
 
 
259 aa  304  8.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  65.33 
 
 
231 aa  296  1e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 
229 aa  285  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  56.84 
 
 
235 aa  282  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  59.29 
 
 
231 aa  281  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  54.74 
 
 
241 aa  278  7e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  61.47 
 
 
233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  63.11 
 
 
230 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  60.61 
 
 
233 aa  269  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  62.11 
 
 
229 aa  268  7e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  58.15 
 
 
233 aa  268  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  57.45 
 
 
238 aa  267  8e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  55.95 
 
 
235 aa  268  8e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  58.04 
 
 
230 aa  267  8.999999999999999e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 
230 aa  267  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 
230 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 
230 aa  266  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 
230 aa  266  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 
230 aa  266  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 
230 aa  266  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 
230 aa  266  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  61.78 
 
 
230 aa  266  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 
230 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2128  ribosomal protein L1  57.26 
 
 
237 aa  266  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  normal  0.786973 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  58.8 
 
 
236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  54.98 
 
 
231 aa  265  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  56.44 
 
 
232 aa  265  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 
230 aa  265  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  54.66 
 
 
242 aa  263  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 
230 aa  263  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  61.23 
 
 
229 aa  262  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  58.59 
 
 
229 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  56.19 
 
 
233 aa  260  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 
231 aa  260  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  56.62 
 
 
229 aa  259  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  53.98 
 
 
233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  56.64 
 
 
235 aa  258  8e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  55.75 
 
 
232 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0846  50S ribosomal protein L1  56 
 
 
232 aa  257  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.408948 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 
230 aa  257  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 
230 aa  257  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  57.92 
 
 
233 aa  256  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 
235 aa  256  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  50.88 
 
 
235 aa  256  3e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  54.74 
 
 
234 aa  255  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  56 
 
 
233 aa  254  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 
232 aa  254  9e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 
234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  57.52 
 
 
232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  55.61 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  55.75 
 
 
226 aa  252  3e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 
237 aa  252  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  54.35 
 
 
234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 
236 aa  251  5.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  54.75 
 
 
230 aa  251  7e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  56.16 
 
 
229 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 
232 aa  251  8.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
234 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  56 
 
 
232 aa  251  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0285  50S ribosomal protein L1  57.99 
 
 
229 aa  250  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105773  hitchhiker  0.00394818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 
232 aa  250  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  54.63 
 
 
232 aa  250  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  53.74 
 
 
232 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1418  50S ribosomal protein L1P  55.16 
 
 
230 aa  250  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>