More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1146 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  100 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  66.96 
 
 		 230 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  64.47 
 
 		 230 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  64.76 
 
 		 230 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  66.96 
 
 		 231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 230 aa  302  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  61.47 
 
 		 231 aa  299  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  63.2 
 
 		 232 aa  298  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  62.22 
 
 		 233 aa  298  5e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  60.18 
 
 		 231 aa  296  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  62.61 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  64.91 
 
 		 229 aa  295  4e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  64.91 
 
 		 229 aa  295  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  63.04 
 
 		 230 aa  293  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  59.29 
 
 		 232 aa  291  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 231 aa  291  7e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  64.47 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  59.65 
 
 		 230 aa  285  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  59.65 
 
 		 230 aa  285  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  64.04 
 
 		 233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  57.63 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 233 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  64.44 
 
 		 230 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  64.44 
 
 		 230 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  64.44 
 
 		 230 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  64.44 
 
 		 230 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  64.44 
 
 		 230 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  64.44 
 
 		 230 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  64.44 
 
 		 230 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  57.46 
 
 		 232 aa  281  9e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  57.52 
 
 		 233 aa  281  9e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  64 
 
 		 230 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 		 230 aa  278  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 		 230 aa  277  8e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  59.83 
 
 		 229 aa  275  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  57.39 
 
 		 235 aa  273  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 235 aa  273  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  57.46 
 
 		 229 aa  272  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  56.71 
 
 		 235 aa  271  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  53.42 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  52.72 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  55.17 
 
 		 242 aa  265  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  56.83 
 
 		 233 aa  264  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 234 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  58.37 
 
 		 233 aa  262  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  55.07 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 234 aa  259  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  58.69 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  54.39 
 
 		 233 aa  259  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 		 233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 234 aa  257  9e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 237 aa  257  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  58.57 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2952  ribosomal protein L1  56.36 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00907027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 232 aa  255  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  55.56 
 
 		 235 aa  255  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  55.61 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 227 aa  255  5e-67  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  57.28 
 
 		 234 aa  254  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  57.28 
 
 		 234 aa  254  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  54.46 
 
 		 230 aa  254  7e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  53.51 
 
 		 234 aa  254  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  54.71 
 
 		 233 aa  254  9e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  54.71 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 231 aa  252  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3327  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24535  normal  0.407372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  53.65 
 
 		 259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  51.49 
 
 		 235 aa  251  5.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  53.1 
 
 		 236 aa  250  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  55.95 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  49.36 
 
 		 234 aa  249  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 231 aa  248  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  52.99 
 
 		 234 aa  248  5e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  52.49 
 
 		 229 aa  248  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 232 aa  248  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 232 aa  248  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 232 aa  248  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 232 aa  248  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0255  50S ribosomal protein L1  53.1 
 
 		 241 aa  248  6e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000222102  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  52.38 
 
 		 232 aa  248  7e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  52.65 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  51.5 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  51.5 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  50.86 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  51.5 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  52.68 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  52.68 
 
 		 229 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  51.69 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>