More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0309 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1418  50S ribosomal protein L1P  65.22 
 
 		 230 aa  320  1.9999999999999998e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214693  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0270  50S ribosomal protein L1  70 
 
 		 230 aa  316  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000998877  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  65.92 
 
 		 230 aa  307  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  60.43 
 
 		 231 aa  295  3e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  60.35 
 
 		 229 aa  294  8e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 230 aa  291  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 230 aa  291  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  61.88 
 
 		 235 aa  290  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  61.61 
 
 		 232 aa  284  9e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  56.39 
 
 		 231 aa  282  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  58.85 
 
 		 233 aa  276  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  58.3 
 
 		 233 aa  275  7e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  58.48 
 
 		 233 aa  274  9e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  61.5 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  60.18 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  61.5 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  58.11 
 
 		 233 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  62.11 
 
 		 230 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 234 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  58.3 
 
 		 230 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  61.06 
 
 		 229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  61.67 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  61.43 
 
 		 229 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  61.67 
 
 		 230 aa  268  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  61.67 
 
 		 230 aa  268  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  61.67 
 
 		 230 aa  268  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  61.67 
 
 		 230 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  61.67 
 
 		 230 aa  268  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  61.67 
 
 		 230 aa  268  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  61.67 
 
 		 230 aa  268  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  56.7 
 
 		 234 aa  268  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  61.67 
 
 		 230 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 231 aa  268  7e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  61.23 
 
 		 230 aa  267  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 233 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  60.54 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  55.16 
 
 		 235 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 233 aa  258  9e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  55.2 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  55.2 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  53.22 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 233 aa  254  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 230 aa  253  3e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  51.98 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  55.61 
 
 		 230 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  54.26 
 
 		 241 aa  250  2e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  54.26 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  54.75 
 
 		 230 aa  248  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  52.19 
 
 		 233 aa  248  5e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 282 aa  248  7e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  56.25 
 
 		 231 aa  248  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  52.7 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  53.12 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 242 aa  245  6e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  52.49 
 
 		 230 aa  244  6.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  51.32 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  55 
 
 		 238 aa  244  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 229 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  51.29 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  55.8 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  51.57 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  53.85 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  54.3 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  53.02 
 
 		 234 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  50.92 
 
 		 229 aa  241  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  53.1 
 
 		 235 aa  241  6e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  53.1 
 
 		 232 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  54.02 
 
 		 233 aa  241  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  54.26 
 
 		 230 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  51.57 
 
 		 236 aa  241  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  55.61 
 
 		 235 aa  241  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 230 aa  241  9e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  53.1 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 231 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  53.1 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  51.35 
 
 		 230 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  53.1 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  51.17 
 
 		 227 aa  239  4e-62  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  51.57 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  51.35 
 
 		 238 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>