More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0255 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0255  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 241 aa  480  1e-135  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000222102  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  66.25 
 
 		 242 aa  332  4e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  52.84 
 
 		 231 aa  251  7e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  50.43 
 
 		 242 aa  249  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 232 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  51.71 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 231 aa  248  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  50.43 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  53.3 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  51.98 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  52.42 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  51.69 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  52.36 
 
 		 242 aa  244  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  50 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  54.87 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  52.59 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  53.1 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0883  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 237 aa  241  5e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.184517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  51.49 
 
 		 234 aa  241  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  52.19 
 
 		 233 aa  241  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  51.05 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  50.43 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  52.4 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  52.4 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  52.4 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  50.21 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 230 aa  238  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  48.71 
 
 		 235 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  50.86 
 
 		 233 aa  238  5.999999999999999e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 233 aa  238  8e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  52.23 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 233 aa  235  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  48.91 
 
 		 235 aa  234  7e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 253 aa  234  8e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  52.75 
 
 		 227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  51.75 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 230 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 230 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 230 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 230 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 230 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 230 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 230 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  49.34 
 
 		 232 aa  233  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 230 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  51.1 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 225 aa  231  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 229 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 229 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  51.75 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  54.78 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  49.56 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  51.54 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  48.7 
 
 		 231 aa  228  4e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  47.88 
 
 		 236 aa  228  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  53.1 
 
 		 236 aa  228  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1666  50S ribosomal protein L1  50.86 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  49.57 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  54.21 
 
 		 232 aa  228  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  49.12 
 
 		 226 aa  228  1e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  48.1 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  50.89 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  48.9 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  48.9 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  48.44 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0992  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 237 aa  226  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000282908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  51.64 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  50.93 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  51.32 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  47.19 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  52.34 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  45.8 
 
 		 242 aa  222  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_864  ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00524668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  50.45 
 
 		 229 aa  222  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  57 
 
 		 235 aa  222  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  51.89 
 
 		 234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 230 aa  221  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1044  ribosomal protein L1  50.21 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.114234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  48.25 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  48.29 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  47.64 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0440  ribosomal protein L1  52.15 
 
 		 235 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  53.02 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  46.89 
 
 		 238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  44.92 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  46.52 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>