More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_12802 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_12802  Plastid ribosomal protein L1 large ribosomal subunit  100 
 
 
209 aa  423  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.397521  normal  0.194456 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  67.33 
 
 
244 aa  290  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0633  50S ribosomal protein L1  65.84 
 
 
237 aa  289  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.846201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  63.86 
 
 
238 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  63.86 
 
 
235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  64.85 
 
 
235 aa  281  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  62.87 
 
 
235 aa  279  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4012  50S ribosomal protein L1  63.86 
 
 
237 aa  279  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0669177  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  62.87 
 
 
235 aa  278  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  62.87 
 
 
238 aa  277  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02791  50S ribosomal protein L1  63.37 
 
 
235 aa  276  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.475982  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1570  50S ribosomal protein L1  63.37 
 
 
235 aa  276  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  62.87 
 
 
238 aa  276  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  61.88 
 
 
235 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  61.39 
 
 
234 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1039  50S ribosomal protein L1  62.38 
 
 
238 aa  270  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0123648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2553  50S ribosomal protein L1  61.88 
 
 
238 aa  268  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000296242  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0264  50S ribosomal protein L1  60.4 
 
 
238 aa  257  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0248875  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2155  50S ribosomal protein L1  66.33 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243526  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  53.06 
 
 
241 aa  227  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  54.27 
 
 
233 aa  226  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  52.33 
 
 
235 aa  225  4e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  53.06 
 
 
231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  51.21 
 
 
242 aa  221  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  53.06 
 
 
233 aa  220  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  51.53 
 
 
233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  50.72 
 
 
242 aa  217  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  52.63 
 
 
242 aa  216  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  52.5 
 
 
237 aa  216  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  50.99 
 
 
235 aa  215  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  51.47 
 
 
233 aa  214  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  51.53 
 
 
234 aa  214  5e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  51.79 
 
 
230 aa  214  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  52.79 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  50.75 
 
 
233 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  51.53 
 
 
235 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  52 
 
 
232 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  51.24 
 
 
235 aa  214  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  51.01 
 
 
235 aa  213  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  50.98 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  50.99 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  51.76 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  51.76 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  51.26 
 
 
234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  49.75 
 
 
237 aa  211  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  52.31 
 
 
231 aa  211  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  50.25 
 
 
233 aa  211  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  52.31 
 
 
230 aa  211  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  52.31 
 
 
230 aa  211  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  54 
 
 
230 aa  210  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  51 
 
 
233 aa  210  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  52.79 
 
 
234 aa  209  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  50.53 
 
 
235 aa  209  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  50.25 
 
 
233 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  49.49 
 
 
232 aa  208  4e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0641  50S ribosomal protein L1  57.73 
 
 
233 aa  208  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284093  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  52.55 
 
 
232 aa  208  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  50 
 
 
232 aa  208  5e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  50 
 
 
233 aa  207  7e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  50 
 
 
233 aa  207  7e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  50 
 
 
233 aa  207  7e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  53.81 
 
 
236 aa  207  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  49.25 
 
 
234 aa  207  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  49 
 
 
232 aa  207  9e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  49.5 
 
 
230 aa  207  9e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  49 
 
 
232 aa  207  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  49 
 
 
232 aa  207  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  55.33 
 
 
230 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  55.33 
 
 
230 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  55.33 
 
 
230 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  55.33 
 
 
230 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  55.33 
 
 
230 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  51.02 
 
 
231 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  55.33 
 
 
230 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  55.33 
 
 
230 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  50.99 
 
 
242 aa  206  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  51.53 
 
 
232 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  55.33 
 
 
230 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  50 
 
 
229 aa  206  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  49 
 
 
232 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  51.27 
 
 
233 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  51.02 
 
 
232 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  47.96 
 
 
231 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  52.28 
 
 
253 aa  206  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  48.53 
 
 
233 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  51.31 
 
 
235 aa  205  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  52.31 
 
 
229 aa  206  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  55.33 
 
 
230 aa  205  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  49.75 
 
 
232 aa  205  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 
230 aa  205  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  50.51 
 
 
231 aa  205  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  50 
 
 
232 aa  205  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  49.75 
 
 
233 aa  205  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  51.02 
 
 
231 aa  204  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  51.02 
 
 
231 aa  204  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  48.5 
 
 
232 aa  204  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  49.49 
 
 
232 aa  204  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  49.49 
 
 
232 aa  204  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  48.47 
 
 
232 aa  203  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0883  50S ribosomal protein L1  49.49 
 
 
237 aa  203  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.184517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>