More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09650 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  100 
 
 		 238 aa  480  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  75.97 
 
 		 236 aa  353  8.999999999999999e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2128  ribosomal protein L1  79.06 
 
 		 237 aa  352  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  normal  0.786973 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  65.81 
 
 		 235 aa  322  3e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  60.68 
 
 		 235 aa  300  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  60.61 
 
 		 236 aa  295  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  57.56 
 
 		 238 aa  290  9e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  60.43 
 
 		 235 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  60.43 
 
 		 235 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  60.43 
 
 		 235 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  58.05 
 
 		 236 aa  287  8e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  59.39 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  57.52 
 
 		 235 aa  285  7e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  56.12 
 
 		 259 aa  284  7e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  55.13 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  57.94 
 
 		 238 aa  281  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  55.17 
 
 		 238 aa  279  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  60.09 
 
 		 230 aa  278  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  56.33 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10654  50S ribosomal protein L1  60.78 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0559095 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  58.04 
 
 		 226 aa  275  3e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 236 aa  275  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  56.72 
 
 		 238 aa  274  8e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  57.64 
 
 		 237 aa  274  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  58.05 
 
 		 237 aa  274  9e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  55.7 
 
 		 239 aa  273  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6060  50S ribosomal protein L1  57.69 
 
 		 237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  56.85 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  57.45 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1113  ribosomal protein L1  58.48 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  56.22 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5115  50S ribosomal protein L1  60.26 
 
 		 239 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  56.84 
 
 		 235 aa  272  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 259 aa  271  5.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  56.11 
 
 		 225 aa  269  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  55.17 
 
 		 235 aa  268  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  55.13 
 
 		 237 aa  268  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  57.51 
 
 		 237 aa  267  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  59.24 
 
 		 242 aa  268  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  57.26 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  57.71 
 
 		 242 aa  265  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  53.88 
 
 		 235 aa  264  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  58.37 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  53.88 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 244 aa  262  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  53.3 
 
 		 231 aa  262  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  57.92 
 
 		 230 aa  262  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  53.88 
 
 		 235 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 238 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 238 aa  261  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 237 aa  261  8.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  55.16 
 
 		 233 aa  261  8.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  54.5 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 231 aa  260  2e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  58.59 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  53.3 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  56.39 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  54.08 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  51.98 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  57.78 
 
 		 235 aa  258  4e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  56.71 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  54.63 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  54.67 
 
 		 231 aa  256  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1441  50S ribosomal protein L1  55.07 
 
 		 232 aa  256  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0252476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  55.95 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  56.96 
 
 		 231 aa  255  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  55.07 
 
 		 229 aa  255  5e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  54.11 
 
 		 235 aa  254  7e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  52.14 
 
 		 234 aa  254  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2334  50S ribosomal protein L1  55.07 
 
 		 231 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.505693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 232 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 230 aa  251  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 230 aa  251  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 231 aa  251  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  53.3 
 
 		 231 aa  251  8.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  56.77 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  55.61 
 
 		 233 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  56.82 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  55.51 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  56.28 
 
 		 237 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 234 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 232 aa  249  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  53.88 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1570  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 235 aa  248  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>