More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2128 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2128  ribosomal protein L1  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  normal  0.786973 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  79.06 
 
 		 238 aa  352  2e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  74.79 
 
 		 236 aa  328  3e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  64.1 
 
 		 235 aa  317  1e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  59.15 
 
 		 235 aa  288  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  59.57 
 
 		 236 aa  286  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  60.26 
 
 		 235 aa  285  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  58.87 
 
 		 259 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  60.61 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 237 aa  282  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  59.83 
 
 		 235 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  59.83 
 
 		 235 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  59.83 
 
 		 235 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  59.48 
 
 		 236 aa  279  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  59.47 
 
 		 236 aa  277  8e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  59.03 
 
 		 238 aa  276  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  59.47 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  58.12 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  56.41 
 
 		 238 aa  275  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  56.84 
 
 		 238 aa  275  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  61.71 
 
 		 230 aa  272  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  58.65 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  57.26 
 
 		 235 aa  271  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  56.65 
 
 		 238 aa  271  9e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  57.69 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  58.87 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  58.87 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  59.19 
 
 		 239 aa  268  7e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1113  ribosomal protein L1  59.53 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  55.84 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  57.69 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10654  50S ribosomal protein L1  58.62 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0559095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 230 aa  262  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 225 aa  262  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5115  50S ribosomal protein L1  57.98 
 
 		 239 aa  262  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  59.83 
 
 		 238 aa  262  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  62.19 
 
 		 226 aa  261  6.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 233 aa  261  8e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  57.71 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  56.17 
 
 		 259 aa  260  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  59.19 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6060  50S ribosomal protein L1  56.84 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  60.79 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  58.52 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  60.98 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  55.66 
 
 		 233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  59.31 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  58.08 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  52.86 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  57.21 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  55.95 
 
 		 231 aa  254  6e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  53.42 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  56.5 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 233 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  59.47 
 
 		 233 aa  252  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 234 aa  251  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 230 aa  251  7e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 232 aa  251  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  59.47 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  58.21 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  58.21 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  58.21 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  58.54 
 
 		 229 aa  248  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  51.52 
 
 		 235 aa  248  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 242 aa  248  7e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  55.86 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  52.34 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  53.12 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  51.08 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 238 aa  245  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  56.16 
 
 		 234 aa  244  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  58.62 
 
 		 231 aa  244  6e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1418  50S ribosomal protein L1P  54.67 
 
 		 230 aa  244  8e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214693  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  56.58 
 
 		 229 aa  244  8e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 226 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  54.19 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  51.57 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  51.57 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>