More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0539 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  100 
 
 
237 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  79.57 
 
 
235 aa  384  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  77.87 
 
 
236 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  83.4 
 
 
237 aa  374  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  76.72 
 
 
238 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  78.02 
 
 
236 aa  371  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  76.5 
 
 
238 aa  367  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  75.64 
 
 
237 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  75.64 
 
 
259 aa  363  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  79.02 
 
 
225 aa  362  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  76.42 
 
 
238 aa  360  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  75.54 
 
 
238 aa  360  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  71 
 
 
238 aa  354  6.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  71 
 
 
238 aa  354  6.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  72.1 
 
 
235 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  79.49 
 
 
239 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  72.05 
 
 
239 aa  343  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  74.79 
 
 
238 aa  341  5e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  73.39 
 
 
238 aa  341  5.999999999999999e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  69.57 
 
 
236 aa  338  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  72.17 
 
 
235 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  72.17 
 
 
235 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  72.17 
 
 
235 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  71.67 
 
 
239 aa  337  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  73.16 
 
 
235 aa  336  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  73.16 
 
 
235 aa  335  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10654  50S ribosomal protein L1  72.53 
 
 
235 aa  329  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0559095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  72.53 
 
 
239 aa  323  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6060  50S ribosomal protein L1  71 
 
 
237 aa  321  6e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166987  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  69.23 
 
 
259 aa  321  8e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5115  50S ribosomal protein L1  71.24 
 
 
239 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  70 
 
 
237 aa  316  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1113  ribosomal protein L1  72.48 
 
 
238 aa  316  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  65.22 
 
 
235 aa  316  3e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  68.14 
 
 
230 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  70.39 
 
 
237 aa  311  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17280  50S ribosomal protein L1  73.52 
 
 
235 aa  311  4.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  70.98 
 
 
230 aa  310  9e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  67.71 
 
 
231 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  61.7 
 
 
241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  61.16 
 
 
231 aa  288  6e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  60.18 
 
 
230 aa  281  9e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  60.44 
 
 
233 aa  280  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 
242 aa  275  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  57.64 
 
 
238 aa  271  6e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 
233 aa  271  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  56.76 
 
 
233 aa  269  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  55.56 
 
 
235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  53.65 
 
 
242 aa  268  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  57.64 
 
 
236 aa  267  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  61.33 
 
 
233 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2128  ribosomal protein L1  58.87 
 
 
237 aa  266  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  normal  0.786973 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  58.04 
 
 
235 aa  265  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  61.88 
 
 
230 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 
231 aa  263  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  60 
 
 
230 aa  264  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  56.5 
 
 
230 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  56.5 
 
 
230 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 
226 aa  262  3e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 
232 aa  262  4e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 
230 aa  262  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 
232 aa  262  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  60.99 
 
 
230 aa  260  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  55.07 
 
 
235 aa  260  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  57.75 
 
 
232 aa  260  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  53.74 
 
 
233 aa  259  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  60.99 
 
 
230 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  60.99 
 
 
230 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  60.99 
 
 
230 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  60.99 
 
 
230 aa  259  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  56.25 
 
 
233 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  60.54 
 
 
230 aa  259  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  60.99 
 
 
230 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  60.99 
 
 
230 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  60.99 
 
 
230 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  54.87 
 
 
227 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  57.52 
 
 
230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  53.45 
 
 
234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  59.56 
 
 
230 aa  258  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  54.74 
 
 
236 aa  258  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  58.22 
 
 
229 aa  258  7e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 
234 aa  257  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  58.49 
 
 
232 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  55.2 
 
 
234 aa  256  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  51.34 
 
 
235 aa  256  3e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 
231 aa  256  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  55.17 
 
 
232 aa  255  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  53.92 
 
 
229 aa  255  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  55.11 
 
 
233 aa  255  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 
237 aa  255  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  60.09 
 
 
230 aa  254  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 
229 aa  254  6e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  54.79 
 
 
229 aa  254  7e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  54.3 
 
 
230 aa  254  8e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  53.36 
 
 
231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  56.25 
 
 
230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  52.17 
 
 
238 aa  251  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  53.98 
 
 
230 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  58.11 
 
 
229 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  58.11 
 
 
229 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>