More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0883 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0883  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.184517  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0992  50S ribosomal protein L1  95.76 
 
 		 237 aa  432  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000282908  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_864  ribosomal protein L1  93.22 
 
 		 237 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00524668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  55.79 
 
 		 242 aa  284  9e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  55.17 
 
 		 231 aa  268  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  55.74 
 
 		 237 aa  265  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 230 aa  265  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  53.68 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  53.3 
 
 		 233 aa  258  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  53.12 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 231 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  54.63 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 235 aa  252  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  49.37 
 
 		 242 aa  251  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  51.54 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  52.59 
 
 		 233 aa  251  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3327  50S ribosomal protein L1  54.31 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24535  normal  0.407372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  51.32 
 
 		 235 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  50.89 
 
 		 233 aa  248  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 236 aa  248  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  51.1 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  51.1 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  51.29 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  49.55 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  53.68 
 
 		 242 aa  246  3e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  52.25 
 
 		 236 aa  245  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  51.75 
 
 		 232 aa  244  8e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  52.36 
 
 		 235 aa  243  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  51.57 
 
 		 225 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  51.32 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  50.21 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0255  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 241 aa  241  5e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000222102  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  50.64 
 
 		 234 aa  242  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  50.21 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  52.16 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  49.36 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  50.21 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  50.22 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  51.72 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  49.36 
 
 		 233 aa  238  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  47.48 
 
 		 238 aa  237  9e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  51.72 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  49.57 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  49.79 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  49.57 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4319  50S ribosomal protein L1  53.45 
 
 		 240 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.686674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  52.68 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  52.68 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  51.72 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  47.37 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  49.34 
 
 		 230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  49.34 
 
 		 230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  51.72 
 
 		 230 aa  235  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  51.72 
 
 		 230 aa  235  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  51.72 
 
 		 230 aa  235  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  51.72 
 
 		 230 aa  235  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  51.72 
 
 		 230 aa  235  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  51.72 
 
 		 230 aa  235  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  51.72 
 
 		 230 aa  235  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  49.34 
 
 		 231 aa  234  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  52.68 
 
 		 230 aa  234  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 231 aa  234  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  51.32 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  51.29 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  46.9 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  51.34 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  48.46 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  46.7 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  48.5 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  48.25 
 
 		 237 aa  231  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  50.23 
 
 		 234 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  47.44 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  51.32 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  49.29 
 
 		 235 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  47.14 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  51.8 
 
 		 226 aa  229  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  49.77 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  47.32 
 
 		 236 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  49.77 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  48 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  46.9 
 
 		 238 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  46.26 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  48.65 
 
 		 234 aa  228  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  48.66 
 
 		 230 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  51.66 
 
 		 244 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  46.9 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  50.43 
 
 		 231 aa  228  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  48.91 
 
 		 237 aa  228  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  51.42 
 
 		 235 aa  228  8e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  48.82 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  48.34 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>