More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2251 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2251  50S ribosomal protein L1P  100 
 
 		 214 aa  428  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000243616  normal  0.144507 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0163  50S ribosomal protein L1P  78.5 
 
 		 214 aa  350  1e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.636993 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0413  50S ribosomal protein L1P  69.63 
 
 		 213 aa  315  4e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0692285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0656  50S ribosomal protein L1P  68.08 
 
 		 215 aa  308  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000420977  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1581  50S ribosomal protein L1P  69.63 
 
 		 213 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000241017  hitchhiker  0.00650077 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0862  ribosomal protein L1  47.34 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1946  50S ribosomal protein L1P  47.66 
 
 		 213 aa  207  7e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0223976  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1421  50S ribosomal protein L1P  43.6 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0614  50S ribosomal protein L1P  43.46 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2186  50S ribosomal protein L1P  43.27 
 
 		 212 aa  188  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2535  50S ribosomal protein L1P  44.12 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.305257  normal  0.182251 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1273  50S ribosomal protein L1P  40.48 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1263  50S ribosomal protein L1P  40.49 
 
 		 213 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.968535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0693  50S ribosomal protein L1P  40.49 
 
 		 213 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1413  50S ribosomal protein L1P  40 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0254  50S ribosomal protein L1P  42.51 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0189  50S ribosomal protein L1P  40.48 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1517  ribosomal protein L1  42.58 
 
 		 210 aa  171  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3518  ribosomal protein L1  42.58 
 
 		 210 aa  171  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0613577  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1928  50S ribosomal protein L1P  36.71 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0382  50S ribosomal protein L1  36.32 
 
 		 220 aa  148  8e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.929915 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0465  50S ribosomal protein L1P  34.91 
 
 		 222 aa  144  9e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.464703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1655  50S ribosomal protein L1P  32.55 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0223  50S ribosomal protein L1P  33.95 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.449707  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1601  50S ribosomal protein L1P  30.52 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.670719  normal  0.978998 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1635  50S ribosomal protein L1P  33.02 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0573324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1833  50S ribosomal protein L1P  34.74 
 
 		 222 aa  125  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.927774 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1316  ribosomal protein L1  31.48 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.685162  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01122  60S ribosomal protein L1 (AFU_orthologue; AFUA_1G11710)  29.61 
 
 		 217 aa  91.7  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.455126  normal  0.294849 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  29.95 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45590  Ribosomal protein L10a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  29.81 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00106944  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  30.41 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03920  60s ribosomal protein l1-a (l10a), putative  28.57 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  27.85 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  29.41 
 
 		 235 aa  85.1  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  31.82 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  26.85 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  26.85 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  27.8 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  29.15 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  31.36 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  30.91 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28359  predicted protein  26.26 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.45008  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  30.33 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1179  50S ribosomal protein L1  28.44 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00131396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  31.98 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  29.86 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  30.19 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  29.49 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  29.86 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  30.24 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  27.92 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  30.36 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  27.92 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  31.1 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  31.1 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  26.83 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2553  50S ribosomal protein L1  29.86 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000296242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89215  predicted protein  25.96 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  27.94 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  30.46 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02791  50S ribosomal protein L1  29.38 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.475982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1570  50S ribosomal protein L1  29.38 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  29.38 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  27.8 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  31.43 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  30.05 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  29.29 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  29.86 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  30.09 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  30.09 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  28.92 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  26.91 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  31.16 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  26.73 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  28.93 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  27.96 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  30 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  29.5 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  27.49 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  27.49 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  26.24 
 
 		 233 aa  74.7  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  27.49 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  30.81 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  26.9 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf143  50S ribosomal protein L1  28.84 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0641  50S ribosomal protein L1  29.22 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  29.91 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  28.37 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  28.43 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  27.49 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  29.44 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  29.44 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0170  50S ribosomal protein L1  29.17 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000255215  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  27.91 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  28 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  28.64 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  25.34 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0568  50S ribosomal protein L1  31.02 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000788355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  26.83 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>