More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0693 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0693  50S ribosomal protein L1P  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1263  50S ribosomal protein L1P  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.968535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1413  50S ribosomal protein L1P  96.24 
 
 		 213 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1273  50S ribosomal protein L1P  91.08 
 
 		 213 aa  394  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0189  50S ribosomal protein L1P  75.12 
 
 		 213 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0862  ribosomal protein L1  47.37 
 
 		 213 aa  201  5e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0656  50S ribosomal protein L1P  44.71 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000420977  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1421  50S ribosomal protein L1P  43.69 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0163  50S ribosomal protein L1P  41.95 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.636993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2251  50S ribosomal protein L1P  40.49 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000243616  normal  0.144507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0413  50S ribosomal protein L1P  41.9 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0692285  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2186  50S ribosomal protein L1P  43.2 
 
 		 212 aa  171  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1581  50S ribosomal protein L1P  39.15 
 
 		 213 aa  168  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000241017  hitchhiker  0.00650077 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1946  50S ribosomal protein L1P  40.1 
 
 		 213 aa  168  7e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0223976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0614  50S ribosomal protein L1P  40.19 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0223  50S ribosomal protein L1P  45.27 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.449707  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0254  50S ribosomal protein L1P  38.86 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1928  50S ribosomal protein L1P  38.54 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1655  50S ribosomal protein L1P  38.65 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1601  50S ribosomal protein L1P  37.2 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.670719  normal  0.978998 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0465  50S ribosomal protein L1P  36.23 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.464703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2535  50S ribosomal protein L1P  37.38 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.305257  normal  0.182251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1517  ribosomal protein L1  38.1 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1316  ribosomal protein L1  39.59 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.685162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3518  ribosomal protein L1  37.14 
 
 		 210 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0613577  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0382  50S ribosomal protein L1  40.22 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.929915 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1635  50S ribosomal protein L1P  35.58 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0573324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1833  50S ribosomal protein L1P  36.89 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.927774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  34.27 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  33.64 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  33.18 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  33.18 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  31.65 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  31.65 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  30.33 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  32.11 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  32.11 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  32.27 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  31.22 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  31.19 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  32.56 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  31.94 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  30.23 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0043  50S ribosomal protein L1  33.95 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236116  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  30.46 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  31.1 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  31.79 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  30.5 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  31.19 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  30.88 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  30.88 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  30.88 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  31.36 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  31.19 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  31.19 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  31.19 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  31.19 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  31.75 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  31.19 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  31.75 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  31.19 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  31.07 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  31.19 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  31.19 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  29.95 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  31 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  30.73 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1247  50S ribosomal protein L1  32.55 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123881  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1208  50S ribosomal protein L1  32.55 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  30.23 
 
 		 229 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0039  50S ribosomal protein L1  32.57 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00138059  hitchhiker  0.00000000000807787 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  31.65 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2869  50S ribosomal protein L1  30.35 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000234009  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  31.65 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  30.3 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  30.3 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1944  50S ribosomal protein L1  32.08 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  29.91 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  31.16 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  32.58 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  31.03 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1666  50S ribosomal protein L1  31.53 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0166  50S ribosomal protein L1  30.15 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0756  50S ribosomal protein L1  32.09 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  29.5 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  29.17 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  30.5 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  30.77 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2553  50S ribosomal protein L1  30.34 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000296242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04533  50S ribosomal protein L1  33.79 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  27.98 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  30.7 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  31.82 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  29.77 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  30.81 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  27.49 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0633  50S ribosomal protein L1  29.49 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.846201 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0316  50S ribosomal protein L1  30.84 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246243  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0487  50S ribosomal protein L1  30.84 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0570658  hitchhiker  0.00000155612 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  31.43 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>