More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0163 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0163  50S ribosomal protein L1P  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.636993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2251  50S ribosomal protein L1P  78.5 
 
 		 214 aa  350  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000243616  normal  0.144507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0413  50S ribosomal protein L1P  75.23 
 
 		 213 aa  332  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0692285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0656  50S ribosomal protein L1P  74.18 
 
 		 215 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000420977  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1581  50S ribosomal protein L1P  72.43 
 
 		 213 aa  310  7.999999999999999e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000241017  hitchhiker  0.00650077 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0862  ribosomal protein L1  53.62 
 
 		 213 aa  231  7.000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1421  50S ribosomal protein L1P  49.52 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1946  50S ribosomal protein L1P  49.53 
 
 		 213 aa  222  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0223976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0614  50S ribosomal protein L1P  43.93 
 
 		 213 aa  201  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2186  50S ribosomal protein L1P  45.19 
 
 		 212 aa  194  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2535  50S ribosomal protein L1P  44.93 
 
 		 212 aa  192  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.305257  normal  0.182251 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0254  50S ribosomal protein L1P  46.08 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0693  50S ribosomal protein L1P  41.95 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1273  50S ribosomal protein L1P  41.63 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1263  50S ribosomal protein L1P  41.95 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.968535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0189  50S ribosomal protein L1P  42.86 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1413  50S ribosomal protein L1P  41.15 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1517  ribosomal protein L1  44.02 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3518  ribosomal protein L1  43.06 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0613577  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0382  50S ribosomal protein L1  36.32 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.929915 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1928  50S ribosomal protein L1P  36.71 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0223  50S ribosomal protein L1P  36.74 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.449707  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0465  50S ribosomal protein L1P  36.59 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.464703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1601  50S ribosomal protein L1P  34.27 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.670719  normal  0.978998 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1655  50S ribosomal protein L1P  37.14 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1635  50S ribosomal protein L1P  34.88 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0573324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1833  50S ribosomal protein L1P  36.15 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.927774 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1316  ribosomal protein L1  34.42 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.685162  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  32.26 
 
 		 229 aa  95.5  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  32.58 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  33.49 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  33.49 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  31.65 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  31.13 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  30.32 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  32.43 
 
 		 232 aa  88.6  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  31.6 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  31.6 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  31.6 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  29.58 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  29.95 
 
 		 234 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  29.95 
 
 		 234 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  29.95 
 
 		 234 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  31.82 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  32.13 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  32.43 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf143  50S ribosomal protein L1  29.77 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  28.96 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45590  Ribosomal protein L10a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.77 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00106944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  31.67 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  30.88 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  32.55 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  31.13 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  31.11 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1179  50S ribosomal protein L1  33.18 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00131396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  32.72 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_004310  BR1247  50S ribosomal protein L1  32.43 
 
 		 233 aa  85.5  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123881  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1208  50S ribosomal protein L1  32.43 
 
 		 233 aa  85.5  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  30.91 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  32.06 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  27.6 
 
 		 230 aa  85.1  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  31.84 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  33.84 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0170  50S ribosomal protein L1  32.39 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000255215  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  33.49 
 
 		 232 aa  84.7  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  28.57 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  30.63 
 
 		 233 aa  84.7  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2869  50S ribosomal protein L1  30.37 
 
 		 234 aa  84.7  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000234009  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  27.8 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  31.13 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  28.29 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  28.29 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  31.07 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  30.45 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1944  50S ribosomal protein L1  32.43 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  30.88 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  30.09 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  29.52 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0709  50S ribosomal protein L1  29.25 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146158  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01122  60S ribosomal protein L1 (AFU_orthologue; AFUA_1G11710)  29.61 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.455126  normal  0.294849 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  32.08 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  31.8 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  32.39 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  31.13 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  30.36 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0633  50S ribosomal protein L1  32.16 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.846201 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  30.77 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0148  ribosomal protein L1  32.41 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000518131  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  30.8 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  31.34 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  30.45 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  29.86 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  30.45 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  29.72 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  29.38 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  30.19 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  30.52 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  30.19 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  30.19 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  29.09 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>