More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1601 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1601  50S ribosomal protein L1P  100 
 
 		 222 aa  435  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.670719  normal  0.978998 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1655  50S ribosomal protein L1P  80.18 
 
 		 222 aa  373  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0465  50S ribosomal protein L1P  78.38 
 
 		 222 aa  358  3e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.464703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1833  50S ribosomal protein L1P  79.73 
 
 		 222 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.927774 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1928  50S ribosomal protein L1P  52.31 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0223  50S ribosomal protein L1P  49.04 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.449707  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1421  50S ribosomal protein L1P  39.41 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0189  50S ribosomal protein L1P  42.72 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1581  50S ribosomal protein L1P  38.68 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000241017  hitchhiker  0.00650077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0656  50S ribosomal protein L1P  35.21 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000420977  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0862  ribosomal protein L1  41.23 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0413  50S ribosomal protein L1P  36.79 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0692285  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1273  50S ribosomal protein L1P  39.39 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1263  50S ribosomal protein L1P  37.2 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.968535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0693  50S ribosomal protein L1P  37.2 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1413  50S ribosomal protein L1P  37.68 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0163  50S ribosomal protein L1P  34.27 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.636993 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1316  ribosomal protein L1  38.54 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.685162  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1946  50S ribosomal protein L1P  36.71 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0223976  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2251  50S ribosomal protein L1P  30.52 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000243616  normal  0.144507 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1635  50S ribosomal protein L1P  34.45 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0573324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0382  50S ribosomal protein L1  34.76 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.929915 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2186  50S ribosomal protein L1P  34.78 
 
 		 212 aa  122  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0254  50S ribosomal protein L1P  35.27 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0614  50S ribosomal protein L1P  31.82 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2535  50S ribosomal protein L1P  34.3 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.305257  normal  0.182251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1517  ribosomal protein L1  31.34 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3518  ribosomal protein L1  31.34 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0613577  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  28.63 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  28.63 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  28.63 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  31.5 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  27.94 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  27.75 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  29.05 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  27.94 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  25.23 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  28.43 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  29.29 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28359  predicted protein  26.64 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.45008  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  27.41 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  28.84 
 
 		 233 aa  74.7  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  30.29 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  27.92 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  30.29 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  28.43 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  27.92 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  28.44 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  29.19 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  28.43 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  27.92 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  26.79 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  29.76 
 
 		 238 aa  72  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  28.93 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  29.44 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  31.25 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  27.41 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  28.86 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  29.19 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  27.41 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  28.43 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  27.14 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  25.98 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  27.41 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  29.19 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  28.18 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  28.16 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  28.18 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0709  50S ribosomal protein L1  29.85 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146158  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01122  60S ribosomal protein L1 (AFU_orthologue; AFUA_1G11710)  30.26 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.455126  normal  0.294849 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2869  50S ribosomal protein L1  28.93 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000234009  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  30.58 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  26.52 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  27.96 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2334  ribosomal protein L1  29.44 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000592022  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  30.05 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  28.29 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  27.15 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  27.03 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  27.03 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  27.45 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  27.41 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  27.18 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1528  50S ribosomal protein L1  27.52 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  27.03 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  26.73 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0883  50S ribosomal protein L1  27.01 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.184517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  26.09 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  29.73 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  28.1 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  26.4 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  26.9 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  27.92 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  26.36 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  28.08 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1347  50S ribosomal protein L1  27.06 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  27.09 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  28.64 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  29.44 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  27.09 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>