More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf143 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf143  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 230 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 227 aa  243  3e-63  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  52.4 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  53.1 
 
 		 226 aa  231  6e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 229 aa  221  6e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  48.66 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  49.55 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  51.18 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  48.66 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  47.35 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2869  50S ribosomal protein L1  47.32 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000234009  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 232 aa  211  9e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0632  50S ribosomal protein L1  48.7 
 
 		 229 aa  211  9e-54  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.00569467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  48.46 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  47.77 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  48.46 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  45.58 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  49.55 
 
 		 232 aa  208  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  48.65 
 
 		 229 aa  208  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  45.78 
 
 		 233 aa  208  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  47.32 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  48 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  46.43 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  47.77 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  45.33 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  46.85 
 
 		 282 aa  205  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  45.54 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  50.94 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  47.77 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  49.55 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  48.21 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  48.02 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  45.09 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  45.09 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  48.46 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  48.47 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  48.47 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  48.47 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  48.47 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  48.47 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  46.49 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  47.75 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  48.47 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  48.47 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  48.02 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  50.47 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0316  50S ribosomal protein L1  46.32 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246243  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0487  50S ribosomal protein L1  46.32 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0570658  hitchhiker  0.00000155612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  47.98 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  48.03 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  46.43 
 
 		 231 aa  201  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0423  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000383524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  48.02 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  48.47 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  44.54 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  46.26 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  44.69 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  48.03 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00040  50S ribosomal protein L1  47.19 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2334  ribosomal protein L1  46.43 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000592022  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  47.14 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  48.34 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0170  50S ribosomal protein L1  45.54 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000255215  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  47.14 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  46.88 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  46.88 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  46.88 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  44.2 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  44.25 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  46.58 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  47.64 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  43.89 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  46.43 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1063  50S ribosomal protein L1  47.58 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0602308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  47.06 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  44.89 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  43.81 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  46.7 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  46.7 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  48.02 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  45.33 
 
 		 232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  46.26 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  45.58 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  43.75 
 
 		 232 aa  194  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  44.64 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  48.13 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  48.13 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  47.32 
 
 		 235 aa  194  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0203  50S ribosomal protein L1  45.54 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000988854  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  44.93 
 
 		 231 aa  193  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  43.95 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4479  50S ribosomal protein L1  43.75 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0614276  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4041  50S ribosomal protein L1  44.2 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000597884  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0148  ribosomal protein L1  45.09 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000518131  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  43.75 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5449  50S ribosomal protein L1  44.2 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000118396  hitchhiker  0.00123384 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4360  50S ribosomal protein L1  43.75 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0197515  normal  0.388445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>