More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0632 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0632  50S ribosomal protein L1  100 
 
 
229 aa  459  9.999999999999999e-129  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.00569467  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  50 
 
 
229 aa  230  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  52 
 
 
226 aa  228  6e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  52.19 
 
 
227 aa  228  9e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  47.32 
 
 
231 aa  222  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  47.32 
 
 
230 aa  221  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  47.32 
 
 
230 aa  221  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  47.6 
 
 
232 aa  221  7e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  45.7 
 
 
230 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  47.77 
 
 
235 aa  214  9e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  47.77 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  45.98 
 
 
231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  43.75 
 
 
232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  44.64 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  48.21 
 
 
232 aa  211  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  46.67 
 
 
232 aa  211  9e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf143  50S ribosomal protein L1  48.7 
 
 
230 aa  211  9e-54  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  44.89 
 
 
235 aa  210  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  48.21 
 
 
232 aa  210  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  47.32 
 
 
233 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  49.12 
 
 
229 aa  209  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  45.7 
 
 
229 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  45.85 
 
 
233 aa  208  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  45.98 
 
 
232 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  45.98 
 
 
232 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  45.98 
 
 
232 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  45.98 
 
 
232 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  45.98 
 
 
232 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  45.98 
 
 
232 aa  208  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  45.98 
 
 
232 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  45.98 
 
 
232 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  46.67 
 
 
233 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  46.52 
 
 
235 aa  207  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  45.54 
 
 
232 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  45.54 
 
 
232 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  44.34 
 
 
229 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  43.42 
 
 
233 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  47.11 
 
 
233 aa  206  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  47.83 
 
 
229 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  45.54 
 
 
232 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  43.75 
 
 
231 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  45.54 
 
 
232 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  45.54 
 
 
232 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  44.64 
 
 
233 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  45.54 
 
 
232 aa  205  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  42.98 
 
 
233 aa  205  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  45.18 
 
 
230 aa  205  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  49.55 
 
 
229 aa  205  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  45.18 
 
 
230 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  45.18 
 
 
230 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  45.18 
 
 
230 aa  205  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  45.18 
 
 
230 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  45.18 
 
 
230 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  45.54 
 
 
232 aa  205  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  45.18 
 
 
230 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  44.64 
 
 
232 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  44.64 
 
 
232 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  47.16 
 
 
232 aa  205  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  44.2 
 
 
231 aa  204  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0846  50S ribosomal protein L1  46.88 
 
 
232 aa  204  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.408948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  47.77 
 
 
235 aa  204  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  45.66 
 
 
229 aa  203  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  45.09 
 
 
232 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  45.18 
 
 
230 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  45.74 
 
 
232 aa  203  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  43.3 
 
 
231 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  43.75 
 
 
231 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  44.74 
 
 
230 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  44.74 
 
 
230 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  47.32 
 
 
235 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  43.44 
 
 
229 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  44.2 
 
 
230 aa  202  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  45.09 
 
 
231 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  45.09 
 
 
231 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  41.63 
 
 
233 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  45.09 
 
 
231 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  46.67 
 
 
232 aa  202  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  45.29 
 
 
232 aa  201  5e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  41.67 
 
 
234 aa  201  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  42.08 
 
 
233 aa  201  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  43.72 
 
 
242 aa  201  9e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0391  50S ribosomal protein L1  46.43 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  41.52 
 
 
232 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  44.3 
 
 
230 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  43.3 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  46.36 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  42.41 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1707  50S ribosomal protein L1  47.27 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  43.64 
 
 
225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  43.75 
 
 
231 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0309  50S ribosomal protein L1P  46.88 
 
 
231 aa  199  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440135  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1347  50S ribosomal protein L1  45.45 
 
 
230 aa  199  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  42.53 
 
 
226 aa  199  3e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1528  50S ribosomal protein L1  46.15 
 
 
230 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  43.75 
 
 
232 aa  199  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5086  50S ribosomal protein L1  46.15 
 
 
230 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00155922  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  43.75 
 
 
238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3361  50S ribosomal protein L1  45.98 
 
 
232 aa  198  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235181  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1418  50S ribosomal protein L1P  43.36 
 
 
230 aa  198  6e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214693  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  45.98 
 
 
238 aa  198  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>