161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42443 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42443  predicted protein  100 
 
 		 1095 aa  2246    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0730577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.88 
 
 		 1831 aa  102  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  21.44 
 
 		 1553 aa  79.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  22.67 
 
 		 1510 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  23.21 
 
 		 696 aa  75.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  22.71 
 
 		 1364 aa  71.2  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22 
 
 		 1481 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  22.54 
 
 		 1766 aa  67.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.76 
 
 		 919 aa  67  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  30.74 
 
 		 1163 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.81 
 
 		 676 aa  63.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2529  WD-40 repeat protein  32.76 
 
 		 248 aa  63.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00110539  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.56 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.65 
 
 		 1363 aa  63.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.69 
 
 		 622 aa  62.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.67 
 
 		 1236 aa  62  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  30.28 
 
 		 742 aa  61.6  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.37 
 
 		 1213 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1229 aa  61.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.45 
 
 		 1760 aa  61.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.56 
 
 		 947 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1552 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  21.58 
 
 		 1188 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.67 
 
 		 1686 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38176  predicted protein  26.64 
 
 		 650 aa  59.7  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.45 
 
 		 636 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  26.75 
 
 		 1477 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10635  SepB protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00210]  26.18 
 
 		 836 aa  58.5  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.568063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  23.43 
 
 		 1211 aa  58.2  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  31.45 
 
 		 1209 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  22.97 
 
 		 1176 aa  57.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  30.39 
 
 		 1334 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  27.54 
 
 		 1183 aa  58.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  23.33 
 
 		 574 aa  57  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.23 
 
 		 1267 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  28.8 
 
 		 1656 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.82 
 
 		 1076 aa  57.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.36 
 
 		 737 aa  57  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.35 
 
 		 740 aa  57  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.24 
 
 		 675 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  22.22 
 
 		 1190 aa  56.2  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.02 
 
 		 1711 aa  55.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  29.28 
 
 		 608 aa  55.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  24.09 
 
 		 346 aa  55.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.22 
 
 		 1348 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.79 
 
 		 930 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1858 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  30 
 
 		 1100 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  28.79 
 
 		 1424 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  21.05 
 
 		 1164 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1097 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62437  predicted protein  27.91 
 
 		 380 aa  53.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.278061  normal  0.0851814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1152 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0547  WD-40 repeat protein  31.2 
 
 		 477 aa  53.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1807 aa  53.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.23 
 
 		 833 aa  53.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.73 
 
 		 642 aa  53.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24854  predicted protein  25.98 
 
 		 878 aa  52.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0065395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  26.98 
 
 		 652 aa  52.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  21.43 
 
 		 1262 aa  52.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.77 
 
 		 1072 aa  52.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  29.59 
 
 		 1344 aa  52.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  24.9 
 
 		 1661 aa  52.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  34.38 
 
 		 1737 aa  52.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  25.15 
 
 		 1279 aa  52.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  26.18 
 
 		 464 aa  52.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  26.22 
 
 		 782 aa  52.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  25.15 
 
 		 1279 aa  52.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05778  actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06500)  27.03 
 
 		 363 aa  52  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  23.1 
 
 		 1399 aa  52  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.75 
 
 		 1557 aa  52  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.37 
 
 		 1609 aa  52  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  22.45 
 
 		 1714 aa  51.6  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  22.83 
 
 		 1304 aa  51.6  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56141  protein involved in cell-cycle regulation of histone transcription  24.8 
 
 		 959 aa  51.6  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0125544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.22 
 
 		 1004 aa  51.6  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03785  component of the chromatin assembly complex (Eurofung)  24.29 
 
 		 684 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  26.27 
 
 		 565 aa  50.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  36.45 
 
 		 954 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  24.78 
 
 		 1190 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 1221 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  27.95 
 
 		 994 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.24 
 
 		 1901 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.66 
 
 		 1072 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  25.7 
 
 		 1242 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  27.56 
 
 		 461 aa  51.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  33.63 
 
 		 317 aa  50.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  33.91 
 
 		 335 aa  50.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.32 
 
 		 757 aa  50.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.22 
 
 		 664 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  28.76 
 
 		 358 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  21.57 
 
 		 1357 aa  50.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  29.7 
 
 		 1401 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  29.68 
 
 		 316 aa  50.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06970  chromatin assembly complex protein, putative  30.86 
 
 		 812 aa  50.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0273376  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02070  trp-asp repeats containing protein, putative  27.27 
 
 		 757 aa  49.7  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.96 
 
 		 1652 aa  49.7  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.39 
 
 		 1856 aa  49.7  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  32.9 
 
 		 872 aa  49.7  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.27 
 
 		 1217 aa  49.7  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>