More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_37270 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_09419  alanyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G03880)  47.49 
 
 
961 aa  839    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000000000381337 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88206  Alanyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  51.79 
 
 
954 aa  872    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.898121 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02520  alanine-tRNA ligase, putative  47.98 
 
 
1012 aa  852    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47999  predicted protein  50.26 
 
 
955 aa  885    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37270  predicted protein  100 
 
 
967 aa  1994    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0476971  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15186  predicted protein  50.12 
 
 
959 aa  820    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
886 aa  601  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0446  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
871 aa  602  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0578  alanyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
879 aa  598  1e-169  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
877 aa  590  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
876 aa  580  1e-164  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5667  alanyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
886 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1560  alanyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
953 aa  582  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80417  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
888 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2535  alanyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
900 aa  569  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
880 aa  567  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04755  alanyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
870 aa  566  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.604916  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2668  alanyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
888 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0302  alanyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
885 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.125416 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0206  alanyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 
888 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2378  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
890 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188776  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0127  alanyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
877 aa  559  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0445567  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1987  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
884 aa  560  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
872 aa  554  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
879 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
892 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
874 aa  549  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
886 aa  546  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1383  alanyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
942 aa  546  1e-154  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0477098  hitchhiker  0.00263773 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  38.47 
 
 
875 aa  545  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
874 aa  544  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 
889 aa  545  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
874 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
876 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
867 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
876 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
876 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5607  alanyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
892 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.346592  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
876 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
887 aa  542  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
876 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
874 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
875 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
890 aa  541  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 
902 aa  539  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
865 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  38 
 
 
903 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
874 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
931 aa  542  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
865 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
897 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
876 aa  538  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
876 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
874 aa  539  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
860 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
896 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
860 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
897 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
865 aa  538  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  37.49 
 
 
876 aa  536  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  37.49 
 
 
876 aa  535  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  37.49 
 
 
876 aa  535  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
876 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
905 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  37.49 
 
 
876 aa  535  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
875 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  37.49 
 
 
876 aa  536  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  37.49 
 
 
876 aa  536  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
876 aa  533  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
884 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
876 aa  534  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
897 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
860 aa  535  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
874 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
885 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
874 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 
860 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 
860 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0096  alanyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
894 aa  532  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.172086  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
875 aa  531  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
874 aa  532  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
876 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
875 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
874 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
882 aa  526  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5505  alanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
886 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
899 aa  529  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2821  alanyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
891 aa  528  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29967  normal  0.126573 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
875 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
874 aa  527  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
876 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
891 aa  528  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
891 aa  528  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
874 aa  525  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
881 aa  523  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2372  alanyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
883 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726035  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 
874 aa  525  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3633  alanyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 
875 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511669  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
874 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
900 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>