More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5667 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 874 aa  646    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 876 aa  666    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 876 aa  664    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 874 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 892 aa  675    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 875 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 876 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 876 aa  951    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 874 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 876 aa  674    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 904 aa  647    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 876 aa  663    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 865 aa  677    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2668  alanyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 888 aa  754    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3738  alanyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 875 aa  640    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 874 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 874 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 876 aa  662    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 874 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 876 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 892 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 875 aa  665    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 874 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 874 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0302  alanyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 885 aa  761    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.125416 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 874 aa  657    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 876 aa  662    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 882 aa  660    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 876 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 880 aa  637    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 876 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 876 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 931 aa  651    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 874 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 874 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0206  alanyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 888 aa  759    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 874 aa  663    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 874 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 882 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 897 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 887 aa  692    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 886 aa  710    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 876 aa  681    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0578  alanyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 879 aa  937    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 864 aa  648    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 874 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 876 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1478  alanyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 882 aa  640    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734898  normal  0.362746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 874 aa  638    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 905 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0127  alanyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 877 aa  949    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0445567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 874 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 876 aa  662    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 874 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 877 aa  647    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 879 aa  981    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 876 aa  659    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 874 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 876 aa  662    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 874 aa  639    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 878 aa  641    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 874 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 877 aa  647    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 876 aa  662    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 860 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 874 aa  663    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 884 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 874 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0087  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 884 aa  638    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000138455  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 872 aa  669    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 897 aa  661    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0096  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 894 aa  651    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.172086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 865 aa  669    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5667  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 886 aa  1820    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 		 877 aa  1103    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 874 aa  638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 863 aa  663    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 874 aa  644    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 876 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 874 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 874 aa  641    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 869 aa  658    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2535  alanyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 900 aa  1027    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 875 aa  655    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 875 aa  642    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 874 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 874 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 878 aa  639    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 874 aa  642    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  42.67 
 
 		 876 aa  666    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 897 aa  663    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 885 aa  643    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0101  alanyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 884 aa  640    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 874 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 875 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 878 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 888 aa  759    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0446  alanyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 		 871 aa  1012    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 886 aa  763    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 875 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>