More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF02520 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_09419  alanyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G03880)  58.73 
 
 		 961 aa  1122    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000381337 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88206  Alanyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  59.85 
 
 		 954 aa  1117    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.898121 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02520  alanine-tRNA ligase, putative  100 
 
 		 1012 aa  2077    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15186  predicted protein  44.14 
 
 		 959 aa  771    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47999  predicted protein  48.51 
 
 		 955 aa  860    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37270  predicted protein  55.93 
 
 		 967 aa  843    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0476971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0446  alanyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 871 aa  594  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 877 aa  592  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1560  alanyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 953 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 886 aa  572  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0127  alanyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 877 aa  568  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0445567  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0206  alanyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 888 aa  567  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1383  alanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 942 aa  563  1.0000000000000001e-159  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0477098  hitchhiker  0.00263773 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2535  alanyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 900 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 888 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5667  alanyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 886 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2668  alanyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 888 aa  559  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 886 aa  557  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 865 aa  557  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 		 879 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 890 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 892 aa  551  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 897 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 876 aa  551  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2378  alanyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 		 890 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 		 897 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 860 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 		 897 aa  549  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 876 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 874 aa  547  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 874 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 876 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 876 aa  545  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 876 aa  546  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0302  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 885 aa  545  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.125416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 876 aa  545  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 876 aa  546  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 876 aa  544  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  37.51 
 
 		 875 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  37.72 
 
 		 876 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 876 aa  545  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 874 aa  545  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  37.49 
 
 		 874 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 874 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 876 aa  540  9.999999999999999e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04755  alanyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 870 aa  541  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.604916  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 876 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 874 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 874 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 874 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 864 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 865 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 876 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 876 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 874 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 875 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 876 aa  539  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 865 aa  539  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 882 aa  538  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 876 aa  539  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 900 aa  537  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 875 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 874 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0578  alanyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 879 aa  535  1e-150  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2405  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 901 aa  535  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.665825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 865 aa  531  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 863 aa  531  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 877 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 877 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 874 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 874 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 874 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 874 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 874 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 874 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 887 aa  527  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  36.37 
 
 		 905 aa  527  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 860 aa  528  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 874 aa  529  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 931 aa  529  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 892 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 874 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 860 aa  526  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 874 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 874 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 904 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 896 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 		 874 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 874 aa  526  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 905 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 891 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 875 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3838  alanyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 937 aa  526  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 884 aa  525  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2821  alanyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 891 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29967  normal  0.126573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0096  alanyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 894 aa  523  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.172086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 905 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 891 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 875 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 878 aa  521  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>