More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1383 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1560  alanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 953 aa  664    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0302  alanyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 885 aa  646    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.125416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 886 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 886 aa  648    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2668  alanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 888 aa  648    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1383  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 942 aa  1944    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0477098  hitchhiker  0.00263773 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3838  alanyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 937 aa  760    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0206  alanyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 888 aa  645    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 888 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 887 aa  629  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0446  alanyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 871 aa  623  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5667  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 886 aa  624  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 876 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 892 aa  603  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04755  alanyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 870 aa  605  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.604916  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 879 aa  601  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 877 aa  600  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0127  alanyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 877 aa  598  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0445567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2535  alanyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 900 aa  598  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88206  Alanyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  39.52 
 
 		 954 aa  597  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.898121 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 876 aa  597  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 876 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 876 aa  594  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2378  alanyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 		 890 aa  595  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 876 aa  595  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 876 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 876 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 876 aa  594  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 863 aa  594  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  39.09 
 
 		 876 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 876 aa  595  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 876 aa  595  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 876 aa  595  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 876 aa  595  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 876 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 876 aa  595  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 860 aa  591  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 860 aa  589  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 903 aa  590  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 877 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 876 aa  588  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 865 aa  586  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 876 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 877 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 874 aa  584  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 874 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 864 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 874 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0578  alanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 879 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 		 869 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 874 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 874 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 860 aa  585  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 875 aa  581  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 865 aa  581  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 874 aa  580  1e-164  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 892 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 876 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 874 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 884 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 860 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 875 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 875 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 874 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 904 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 881 aa  575  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 900 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 867 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 883 aa  572  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  43.99 
 
 		 873 aa  570  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 874 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 860 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 875 aa  572  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 874 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 874 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 875 aa  571  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 872 aa  572  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 878 aa  570  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 874 aa  571  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 874 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 874 aa  568  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 897 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 876 aa  568  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 874 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 899 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 874 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 874 aa  568  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 874 aa  569  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 874 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 874 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 890 aa  567  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 897 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 874 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 892 aa  567  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 872 aa  566  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 874 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 897 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 888 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 874 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 874 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>