More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0446 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 892 aa  663    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 876 aa  656    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 876 aa  656    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 874 aa  653    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 874 aa  682    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 875 aa  703    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 874 aa  645    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 876 aa  927    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 874 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 867 aa  646    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 897 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 876 aa  653    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 892 aa  672    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 874 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 892 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 885 aa  642    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 874 aa  662    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 874 aa  673    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 883 aa  637    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 874 aa  665    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 865 aa  660    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 874 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 860 aa  680    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 860 aa  678    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 875 aa  671    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 899 aa  655    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 874 aa  660    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 885 aa  643    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 897 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 876 aa  690    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 874 aa  662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 872 aa  648    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 874 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1987  alanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 885 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363624  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 874 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0451  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 883 aa  640    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 882 aa  688    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 897 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 887 aa  719    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 886 aa  753    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 876 aa  699    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 880 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 864 aa  670    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 905 aa  681    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 863 aa  670    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 904 aa  665    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 874 aa  675    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 881 aa  645    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 874 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 905 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 875 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1279  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 881 aa  636    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2628  alanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 874 aa  636    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 878 aa  645    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 875 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 872 aa  646    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 876 aa  654    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 878 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 874 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 874 aa  671    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 931 aa  695    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 887 aa  650    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 875 aa  651    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 890 aa  643    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 884 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88206  Alanyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  47.25 
 
 		 954 aa  639    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.898121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 902 aa  657    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 874 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 897 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 874 aa  653    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 865 aa  677    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1266  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 909 aa  645    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  62.06 
 
 		 877 aa  1118    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 879 aa  688    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 874 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 874 aa  657    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 874 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 874 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 869 aa  664    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 874 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 880 aa  649    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 879 aa  949    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 874 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 874 aa  673    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 874 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 903 aa  637    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 880 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 876 aa  658    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2104  alanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 883 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653271  normal  0.762887 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 897 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 885 aa  687    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 876 aa  654    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 874 aa  668    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 874 aa  666    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 878 aa  701    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 888 aa  785    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 885 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 900 aa  662    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 860 aa  679    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>