More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2378 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 904 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 876 aa  650    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 876 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 874 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 876 aa  665    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 875 aa  667    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 876 aa  924    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 874 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2668  alanyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 888 aa  753    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 931 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 875 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 872 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 874 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 874 aa  658    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 		 874 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 876 aa  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 874 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 886 aa  777    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 874 aa  658    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 905 aa  648    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 876 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 876 aa  646    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0096  alanyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 894 aa  663    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.172086  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 860 aa  635    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 872 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0578  alanyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 879 aa  968    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 876 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 874 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 905 aa  660    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 892 aa  659    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 892 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3838  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 937 aa  640    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 874 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0206  alanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 888 aa  771    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 874 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 874 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 882 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 897 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 887 aa  697    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 886 aa  722    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 876 aa  682    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 880 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 864 aa  661    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 865 aa  666    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 876 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 874 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 882 aa  648    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1268  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 876 aa  640    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 881 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 874 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 905 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 874 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 874 aa  660    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 875 aa  655    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 865 aa  644    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 876 aa  648    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 874 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 876 aa  647    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 876 aa  668    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 874 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 874 aa  663    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 860 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 875 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 860 aa  637    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 884 aa  643    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 875 aa  645    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0302  alanyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 885 aa  774    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.125416 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 863 aa  636    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 897 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 874 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 865 aa  675    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  58.91 
 
 		 879 aa  999    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 877 aa  1140    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 876 aa  645    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 879 aa  661    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 874 aa  644    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 874 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 874 aa  656    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 874 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 869 aa  651    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 874 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 874 aa  651    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 876 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 874 aa  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 874 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 874 aa  665    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 876 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 874 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 897 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 885 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 874 aa  661    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 874 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 875 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 878 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 888 aa  766    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1478  alanyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 882 aa  645    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734898  normal  0.362746 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 900 aa  648    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 876 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 876 aa  669    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>