More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2535 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 876 aa  650    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 876 aa  651    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 876 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 876 aa  930    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 876 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 874 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2668  alanyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 888 aa  725    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 876 aa  648    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0302  alanyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 885 aa  747    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.125416 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 880 aa  635    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1560  alanyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 953 aa  829    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 860 aa  638    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2535  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 900 aa  1863    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 876 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0206  alanyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 888 aa  741    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 876 aa  649    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 876 aa  650    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0446  alanyl-tRNA synthetase  59.76 
 
 		 871 aa  1076    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 876 aa  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 882 aa  654    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 887 aa  684    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 886 aa  701    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 876 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 880 aa  648    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 905 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 886 aa  754    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 904 aa  646    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  42.21 
 
 		 876 aa  650    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 905 aa  636    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 875 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 860 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 865 aa  652    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0578  alanyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 879 aa  957    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 876 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 879 aa  664    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2378  alanyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 890 aa  1018    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 879 aa  640    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04755  alanyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 870 aa  995    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.604916  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  60.8 
 
 		 877 aa  1125    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5667  alanyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 886 aa  1027    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0877  alanyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 879 aa  647    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.438968 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 905 aa  652    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 860 aa  650    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 874 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 876 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 931 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 		 879 aa  961    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0127  alanyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 877 aa  942    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0445567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 865 aa  640    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 876 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 878 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 888 aa  738    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 876 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 876 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 892 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 860 aa  633  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 897 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 874 aa  633  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 874 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 897 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 897 aa  635  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 905 aa  629  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 865 aa  632  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 890 aa  627  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3838  alanyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 937 aa  626  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 876 aa  625  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 884 aa  627  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 875 aa  626  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 874 aa  627  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 869 aa  628  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 856 aa  625  1e-178  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 860 aa  628  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 882 aa  623  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 875 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 875 aa  624  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 875 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 892 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 876 aa  623  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 874 aa  625  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 875 aa  623  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3738  alanyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 875 aa  624  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 874 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 876 aa  625  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 867 aa  622  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 863 aa  622  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 874 aa  621  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  41.23 
 
 		 873 aa  619  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 864 aa  622  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0096  alanyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 894 aa  621  1e-176  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.172086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 874 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 874 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 877 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 874 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 874 aa  621  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 863 aa  620  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 877 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 874 aa  621  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 874 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 878 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 874 aa  616  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>