More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47999 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_09419  alanyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G03880)  46.61 
 
 		 961 aa  819    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000381337 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47999  predicted protein  100 
 
 		 955 aa  1984    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88206  Alanyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  47.67 
 
 		 954 aa  815    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.898121 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02520  alanine-tRNA ligase, putative  48.51 
 
 		 1012 aa  851    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37270  predicted protein  54.53 
 
 		 967 aa  863    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0476971  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15186  predicted protein  47.32 
 
 		 959 aa  838    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 876 aa  576  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 876 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  38.44 
 
 		 876 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 876 aa  568  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 876 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 876 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 876 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 876 aa  566  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 876 aa  568  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 876 aa  568  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 876 aa  567  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 876 aa  567  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 876 aa  568  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 876 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 876 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 892 aa  561  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 877 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 874 aa  561  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 877 aa  560  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 877 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 875 aa  558  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 886 aa  558  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0578  alanyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 879 aa  558  1e-157  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0127  alanyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 877 aa  559  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0445567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 865 aa  557  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 874 aa  553  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04755  alanyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 870 aa  555  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.604916  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 865 aa  551  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0446  alanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 871 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 874 aa  547  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 860 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2668  alanyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 888 aa  548  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 		 896 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 903 aa  545  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 874 aa  545  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 875 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 888 aa  545  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 879 aa  541  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 860 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0302  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 885 aa  539  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.125416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 886 aa  542  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1987  alanyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 884 aa  540  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0206  alanyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 888 aa  538  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 874 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 860 aa  536  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 865 aa  538  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 880 aa  539  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 875 aa  538  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 885 aa  537  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1383  alanyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 942 aa  533  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0477098  hitchhiker  0.00263773 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1560  alanyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 953 aa  532  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80417  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 875 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 892 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 889 aa  533  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 875 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 900 aa  535  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 874 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 875 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 874 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 874 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 874 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  37.51 
 
 		 874 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 874 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  37.51 
 
 		 874 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2535  alanyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 900 aa  529  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 867 aa  532  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 874 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 860 aa  528  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 860 aa  529  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 876 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0096  alanyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 894 aa  528  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.172086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 		 890 aa  529  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 876 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 		 874 aa  529  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 		 869 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 874 aa  527  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 875 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 890 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 905 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1614  alanyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 869 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  37.71 
 
 		 873 aa  521  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 890 aa  519  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 891 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 875 aa  522  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 884 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 879 aa  522  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 863 aa  522  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 931 aa  518  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 865 aa  518  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1460  alanyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 890 aa  519  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.124208  hitchhiker  0.00581407 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2372  alanyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 883 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726035  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 874 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 897 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 882 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>