107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6138 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 		 303 aa  614  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5650  cyclic nucleotide-binding  39.39 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2709  TPR repeat-containing protein  45.33 
 
 		 500 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678086  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0444  tetratricopeptide domain-containing protein  39.74 
 
 		 481 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.317749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  41.46 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2866  hypothetical protein  41.46 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3177  hypothetical protein  49.02 
 
 		 103 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.211296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  40.16 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.44 
 
 		 1056 aa  55.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  30.22 
 
 		 570 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  27.63 
 
 		 164 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  28.87 
 
 		 413 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  30.28 
 
 		 124 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0722  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.58 
 
 		 243 aa  52.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000366193  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  37.33 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  25.83 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  39.47 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 512 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  40.24 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  31.18 
 
 		 233 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  27.27 
 
 		 210 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  27.27 
 
 		 210 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  27.27 
 
 		 210 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  27.27 
 
 		 210 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  27.27 
 
 		 210 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  27.27 
 
 		 210 aa  49.3  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  26.47 
 
 		 265 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  27.27 
 
 		 210 aa  48.9  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.27 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  27.27 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  27.27 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  27.27 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  30.1 
 
 		 147 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  27.27 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  27.27 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1866  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.24 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  25.74 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  23.68 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  27.5 
 
 		 639 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  26.26 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  35.63 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  30.56 
 
 		 151 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  34.52 
 
 		 596 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 151 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  29.9 
 
 		 425 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.9 
 
 		 425 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  30.86 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  23.68 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  23.68 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  23.68 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  35.16 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  31.13 
 
 		 832 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  35.16 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  29.52 
 
 		 217 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 		 832 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  23.68 
 
 		 210 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  37.65 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  29.81 
 
 		 148 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  26.26 
 
 		 210 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  24.68 
 
 		 721 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  36.36 
 
 		 367 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  34.67 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  26.26 
 
 		 210 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  27.78 
 
 		 212 aa  46.2  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  31 
 
 		 832 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4796  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  27.93 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370555  unclonable  0.0000216721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4903  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.41 
 
 		 163 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  33.8 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  30.39 
 
 		 149 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.08 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0102  cyclic nucleotide-binding protein  25.42 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  34.83 
 
 		 127 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0093  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.132878  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  26.26 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.09 
 
 		 146 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  32.1 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2593  cyclic nucleotide-binding protein  30.86 
 
 		 707 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223415 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  22.81 
 
 		 210 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  29.41 
 
 		 149 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 		 219 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  24.03 
 
 		 721 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.67 
 
 		 624 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  22.81 
 
 		 210 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  27.97 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  26.17 
 
 		 563 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 226 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 229 aa  43.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 141 aa  43.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  29.41 
 
 		 194 aa  43.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  23.02 
 
 		 621 aa  42.7  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  23.53 
 
 		 211 aa  42.7  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  24.51 
 
 		 211 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>