31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3111 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  100 
 
 		 268 aa  553  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  52.5 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  48.78 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  49.34 
 
 		 151 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  52.38 
 
 		 596 aa  152  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  50 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  40.2 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  47.68 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  43.45 
 
 		 291 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  36.96 
 
 		 507 aa  122  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  44.59 
 
 		 291 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  41.61 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  37.37 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  40.97 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  40.97 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  37.06 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  41.6 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  43.7 
 
 		 127 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3059  hypothetical protein  51.39 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.828132  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  29.05 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  25.36 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  30.15 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  29.37 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1435  hypothetical protein  25.47 
 
 		 433 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5650  cyclic nucleotide-binding  35.82 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6577  hypothetical protein  31.34 
 
 		 585 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  39.47 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  27.63 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  26.58 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0444  tetratricopeptide domain-containing protein  28.32 
 
 		 481 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.317749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>