40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5650 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5650  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 		 300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  39.39 
 
 		 303 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0444  tetratricopeptide domain-containing protein  36.59 
 
 		 481 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.317749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2709  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 500 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678086  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  31.58 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2866  hypothetical protein  30.92 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3177  hypothetical protein  39.22 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.211296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  34.45 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  32.04 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  32.17 
 
 		 449 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  35.82 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.06 
 
 		 597 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  38.57 
 
 		 151 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1668  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 209 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.637535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1049  cyclic nucleotide-binding protein  30.21 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085615  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  32.69 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  32.69 
 
 		 215 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  30.85 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  30.85 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  37.08 
 
 		 594 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4796  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  28.97 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370555  unclonable  0.0000216721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  29.41 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3601  cyclic nucleotide-binding  32.47 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0690816  normal  0.803864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  30.36 
 
 		 124 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  25.78 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2689  cyclic nucleotide-binding protein  30.21 
 
 		 208 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.0072891  normal  0.636365 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0560  cyclic nucleotide-binding  29.87 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  31.08 
 
 		 277 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1461  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 159 aa  43.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  30.63 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.45 
 
 		 214 aa  42.7  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7109  cyclic nucleotide-binding protein  27.91 
 
 		 222 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 224 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.5 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  29.63 
 
 		 621 aa  42.7  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2994  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  33.66 
 
 		 403 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0579773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1913  cyclic nucleotide-binding protein  31.17 
 
 		 224 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4022  cyclic nucleotide-binding protein  30.25 
 
 		 166 aa  42.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  30.87 
 
 		 832 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>