21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3082 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2866  hypothetical protein  64.87 
 
 		 280 aa  374  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2709  TPR repeat-containing protein  45.75 
 
 		 500 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678086  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0444  tetratricopeptide domain-containing protein  44.91 
 
 		 481 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.317749  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  41.46 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  36.3 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5650  cyclic nucleotide-binding  31.58 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  37.33 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  32.05 
 
 		 151 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  27.18 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  29.13 
 
 		 596 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  30.93 
 
 		 127 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4041  hypothetical protein  33.82 
 
 		 108 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  31.82 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  30.49 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  28.44 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  28.44 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  28.97 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  26.58 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  26.05 
 
 		 233 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>