24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1366 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0444  tetratricopeptide domain-containing protein  44.72 
 
 		 481 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.317749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2709  TPR repeat-containing protein  40.65 
 
 		 500 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678086  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  36.3 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2866  hypothetical protein  39.34 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  40.16 
 
 		 303 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5650  cyclic nucleotide-binding  34.45 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  35.29 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  31.76 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  33.33 
 
 		 596 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  32.67 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  25.2 
 
 		 261 aa  50.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  40.85 
 
 		 151 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  27.64 
 
 		 313 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  33.82 
 
 		 127 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  31.82 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  31.82 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  29.9 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  31.08 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  27.68 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  30.14 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  25 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  33.82 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>