26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1741 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  100 
 
 		 302 aa  622  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  37.4 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  42.59 
 
 		 287 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  39.08 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  35.35 
 
 		 273 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  35.35 
 
 		 273 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  41.32 
 
 		 151 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  38.24 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  38.04 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  35.32 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  39.75 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  37.06 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  35.58 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  36.59 
 
 		 507 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  37.65 
 
 		 596 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  33.53 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  38.18 
 
 		 233 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  34.8 
 
 		 234 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  37.76 
 
 		 127 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  30 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  29.15 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3059  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.828132  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  26 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  34.88 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  33.8 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0444  tetratricopeptide domain-containing protein  28.99 
 
 		 481 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.317749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>