25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2305 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  100 
 
 		 291 aa  597  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  56.29 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  39.35 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  52.05 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  54.49 
 
 		 268 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  43.65 
 
 		 301 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  40.5 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  44.59 
 
 		 151 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  43.45 
 
 		 596 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  43.45 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  43.05 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  43.05 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  44.9 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  35.38 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  35.32 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  36.49 
 
 		 507 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  45.05 
 
 		 127 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  36 
 
 		 233 aa  96.3  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3059  hypothetical protein  36.11 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.828132  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  36.72 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  33.05 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1435  hypothetical protein  23.4 
 
 		 433 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  32.76 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0444  tetratricopeptide domain-containing protein  34.09 
 
 		 481 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.317749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  33.82 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>