20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3059 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3059  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.828132  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  47.62 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  47.62 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  36.11 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  59.02 
 
 		 287 aa  78.6  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  57.81 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  51.39 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  49.32 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  55.56 
 
 		 151 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  36.78 
 
 		 507 aa  73.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  46.67 
 
 		 596 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  47.95 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  50 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  47.54 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  49.3 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  42.19 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  44.78 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  42.65 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  45.16 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  57.58 
 
 		 127 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>