28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2614 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  478  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  85.02 
 
 		 234 aa  358  6e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  42.69 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  39.29 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  42 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  40 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  42 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  39.22 
 
 		 151 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  44.37 
 
 		 271 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  41.03 
 
 		 596 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  38.18 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  43.45 
 
 		 507 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  43.18 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  41.61 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  45.38 
 
 		 301 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  35 
 
 		 291 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  38.99 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  42.62 
 
 		 291 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  39.83 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  30.32 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  30.6 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3059  hypothetical protein  42.65 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.828132  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6577  hypothetical protein  30.67 
 
 		 585 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2319  hypothetical protein  26.03 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2164  hypothetical protein  27.35 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.107733 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  30.85 
 
 		 303 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  26.05 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2709  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 500 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>