28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_4098 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  557  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  557  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  33.69 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  40.59 
 
 
287 aa  133  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  45.14 
 
 
151 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  43.05 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  42.76 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  35.35 
 
 
302 aa  122  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  42.76 
 
 
596 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  31.86 
 
 
507 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  41.38 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  40.97 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  42 
 
 
233 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  43.44 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  39.66 
 
 
268 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  38.61 
 
 
271 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  43.22 
 
 
127 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  40.48 
 
 
234 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3059  hypothetical protein  47.62 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.828132  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  32.62 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  27.67 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6138  cyclic nucleotide-binding  34.07 
 
 
303 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1366  nucleotide-binding protein containing TIR -like domain-like protein  31.82 
 
 
306 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243127  normal  0.0934242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6577  hypothetical protein  27.03 
 
 
585 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  28.44 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2866  hypothetical protein  31.76 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  30 
 
 
303 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>